Abstract
Horizontale gen transfer (HGT) speelt een belangrijke rol in de evolutie van bacteriën, zoals bij opname van genen verantwoordelijk voor antibioticaresistentie en virulentiefactoren. Hierdoor kunnen deze bacteriën zich aanpassen aan veranderende omgevingen. Desondanks blijft de omvang en impact van HGT op de evolutie van Salmonella, met name naar toenemende invasiviteit, slecht begrepen. Dit project beoogt dan ook om het belang van HGT in de evolutie van invasieve Salmonella (S.) enterica serovar Typhimurium, een belangrijke veroorzaker van invasieve niet-tyfoïdale salmonellose (iNTS) in sub-Sahara Afrika, op te helderen. Door bio-informatica te integreren met klassieke bacteriële laboratoriumtechnieken, streeft dit project ernaar om HGT te karakteriseren en de recombinatie frequentie te bepalen in invasieve klinische isolaten, met behulp van pan-genoom analyses, fylogenetische analyses en bacteriële recombinatietechnieken. Bovendien zal een nieuwe technologie ontwikkeld worden voor de reconstructie van uitgestorven voorouderstammen aan de hand van recombinatie. De resultaten zullen bijdragen aan een beter begrip van bacteriële evolutie en iNTS pathogenese, met mogelijke implicaties voor de volksgezondheid. De toepassing van recombinatie om voorouderstammen te reconstrueren zal daarenboven baanbrekend zijn vanuit een synthetisch-biologisch perspectief.
Onderzoeker(s)
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)