Onderzoek Jean-Pierre Timmermans

Abstract

Mestcellen zijn immuun cellen die typisch geassocieerd worden met allergische reacties ter hoogte van mucosale oppervlakken. Hier kunnen mestcellen interageren met sensorische zenuwen en zo bijdragen tot jeuk en pijn sensaties. In de context van het prikkelbare darmsyndroom (PDS), een frequent chronische darmaandoening die gekenmerkt wordt door een abnormale pijnsignalisatie (i.e. viscerale overgevoeligheid), is de betrokkenheid van abnormaal geactiveerde mestcellen erkend, maar de precieze receptoren en signaalmechanismen die deze afwijkende werking aansturen blijven slecht begrepen. In ons labo werd recent de aanwezigheid van een nieuwe IgE-onafhankelijke, 'pseudo-allergische' activeringsroute van mestcellen in de dikke darm ontdekt, bestaande uit muis Mrgprb2 en zijn humane tegenhanger MRGPRX2. In dit doctoraatsproject richt ik mij op de specifieke rol van deze nieuwe Mrgprb2/X2-gemedieerde pathway als drijvende kracht voor de afwijkende werking van mestcellen in de pathofysiologie van IBS en daarmee geassocieerde viscerale overgevoeligheid. Op deze manier levert dit doctoraatsproject nieuwe perspectieven in ons begrip over de pathofysiologie van IBS. Verder, kan dit doctoraatsproject een solide basis vormen voor verdere studies naar het therapeutisch potentieel van deze pathway in deze aandoening.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Ibiza Martinez Sales
• Mandaathouder: Lambeets Lana

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het Centrum voor Geavanceerde Microscopie Antwerpen (ACAM) biedt een hoogwaardige service voor het visualiseren van biologische stalen op nano- tot mesoschaal. Haar missie is om een attractiepool te zijn voor hoogstaande microscopie en kwantitatieve beeldvormingsexpertise en om zo onderzoeksexcellentie aan de Universiteit Antwerpen te bevorderen. Om dit te realiseren, biedt ACAM ondersteuning bij projectplanning, staalvoorbereiding, microscoopselectie en - gebruik, beeldanalyse en -visualisatie en interpretatie. ACAM beheert 10 geavanceerde microscoopsystemen, een server voor beeldgegevensopslag en verschillende werkstations voor beeldanalyse. Hoogdimensionele beeldvorming is een speerpunt met light sheet microscopie, ultrasnelle live cell imaging en high-throughput microscopie als voornaamste technologieën. Naast het verwerven en onderhouden van nieuwe hardware, ontwikkelt ACAM zijn eigen software-algoritmes en evalueert de faciliteit nieuwe experimentele opstellingen. Er worden routinematig trainingen en thematische cursussen georganiseerd zodat er voldoende achtergrondinformatie is over nieuwe technologieën, optimaal gebruik van apparatuur en experimentele reproduceerbaarheid. ACAM voert een open science-beleid en investeert om alle data te laten voldoen aan het FAIR-principe. Door een brede waaier aan technologiën aan te bieden en door de nieuwe evoluties binnen de microscopie nauw op te volgen, wil ACAM onderzoekers in staat stellen om wetenschap met een hoge impact uit te voeren.

Onderzoeker(s)

• Promotor: De Vos Winnok
• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: De Vos Winnok
• Co-promotor: Kumar-Singh Samir
• Co-promotor: Pintelon Isabel
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project website

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Teneinde de grenzen van de gepersonaliseerde geneeskunde te verleggen, maakt IMARK maximaal gebruik van de stevige aan de Universiteit Antwerpen verankerde expertise op het gebied van biomedische beeldvorming. Door moleculaire en structurele patronen in ruimte en tijd in kaart te brengen, wil IMARK sneller nieuwe biomerkers identificeren en ontwikkelen. Daartoe hebben zich in het consortium een aantal onderzoeksgroepen verenigd met complementaire kennis en apparatuur die alle aspecten van op beeldvorming gebaseerd fundamenteel onderzoek, preklinische validering en klinische evaluatie bestrijken. IMARK beschikt over moderne infrastructuur voor elektronen- en lichtmicroscopie, massaspectrometrie beeldvorming, MRI, CT, PET en SPECT. Daarnaast ontwikkelen de IMARK-partners correlatieve beeldvormende methoden ter dataverrijking en werken ze aan op maat gemaakte beeldanalyse-protocollen/oplossingen waarmee krachtige, kwalitatieve uitlezingen verkregen worden. Dankzij deze unieke bundeling van technologie en expertise is IMARK de ideale, bevoorrechte partner voor samenwerking tussen de particuliere en publieke sector en beschikt het over een strategisch voordeel om zijn reeds substantiële IP-portfolio nog verder uit te breiden. De belangrijkste toepassingsgebieden van het consortium zijn neurowetenschappen en oncologie. Vermits de IMARK-partners samenwerken of geaffilieerd zijn met het Universitair Ziekenhuis Antwerpen en het Universitair Psychiatrisch Centrum Duffel, is er rechtstreeks toegang tot patiëntengegevens/-stalen en zijn er volop mogelijkheden voor translationeel onderzoek.

Onderzoeker(s)

• Promotor: De Vos Winnok
• Co-promotor: Baets Jonathan
• Co-promotor: Baggerman Geert
• Co-promotor: Bertoglio Daniele
• Co-promotor: Bogers John-Paul
• Co-promotor: Coppens Violette
• Co-promotor: Elvas Filipe
• Co-promotor: Keliris Georgios A.
• Co-promotor: Kumar-Singh Samir
• Co-promotor: Mertens Inge
• Co-promotor: Morrens Manuel
• Co-promotor: Staelens Steven
• Co-promotor: Stroobants Sigrid
• Co-promotor: Timmerman Vincent
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Verhaeghe Jeroen
• Co-promotor: Verhoye Marleen
• Mandaathouder: Lanens Dirk
• Mandaathouder: Prasad Aparna

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Neuropathologie is een interdisciplinair onderzoeksveld waarbij beeldvorming en beeldgestuurde interventies onmisbaar geworden zijn. De snelle groei van diepgravende onderzoekstechnologieën en de verschillende schalen waarop deze werken, hebben echter geleid tot een knelpunt op het niveau van integratie, enerzijds van de verschillende beeld datasets onderling, en anderzijds van de multimodale beeldinformatie met omics-afgeleide en klinische gegevensbanken. Om te voldoen aan de groeiende nood voor holistische interpretatie van multischaal- (molecule, cel, organ(oid), organisme) en meerlagige (beeldvorming, omica, chemo-fysisch) informatie over de (dys)functie van het centraal en perifeer zenuwstelsel, stellen we μNEURO voor, een consortium dat bestaat uit 8 gevestigde teams met complementaire expertise in neurologie, biomedische en microscopische beeldvorming, elektrofysiologie, functionele genetica and geavanceerde data analyse. Het doel van μNEURO is om neuropathologisch onderzoek te stimuleren en nieuwe pathogene mechanismen te identificeren die betrokken zijn bij neuro-ontwikkelings- and -degeneratieve aandoeningen (bvb., Alzheimer's ziekte, epilepsie, Charcot-Marie-Tooth) en dit op een cel-tot-organisme brede schaal. Het verwerken van grote spatiotemporele beeld data en de cross-correlatie van multimodale beelden met gerichte verstoringen staat centraal. Bovendien zal de inclusie van (pre) klinische teams de vertaling naar een klinische setting versnellen en toelaten klinische gevallen te doorgronden met behulp van dier- en cellulaire modellen. Als kenniscentrum voor neuro-georiënteerde beeldomica bevordert μNEURO vooruitgang voor de universiteit en de gemeenschap, waaronder i) nieuwe inzichten in moleculaire pathways van aandoeningen van het zenuwstelsel; ii) nieuwe hulpmiddelen en modellen die uitgebreide experimenten en integrale analyse mogelijk maken; iii) verbeterde translationele pipeline voor ontwikkelen en validatie van nieuwe diagnostische biomarkers en therapeutische chemische samenstellingen; iv) verbeterde zichtbaarheid, samenwerking en internationaal gewicht en concurrentievoordeel voor grote multi-partner onderzoeksprojecten.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Sijbers Jan
• Co-promotor: Baets Jonathan
• Co-promotor: Cras Patrick
• Co-promotor: De Vos Winnok
• Co-promotor: Giugliano Michele
• Co-promotor: Kumar-Singh Samir
• Co-promotor: Staelens Steven
• Co-promotor: Stroobants Sigrid
• Co-promotor: Timmerman Vincent
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Verhoye Marleen
• Co-promotor: Weckhuysen Sarah

Onderzoeksgroep(en)

• Visielab

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Cryo-elektronenmicroscopie (cryo-EM) is de afgelopen vijf jaar enorm geëvolueerd, waardoor het een veelbelovende methode is geworden om structurele informatie te verkrijgen over eiwitten met een relevantie in de menselijke (patho)fysiologie (bvb. kanker, gastheer-pathogeen interacties, neuropathologieën). Deze snelle evolutie heeft de interesse van farmaceutische bedrijven in cryo-EM aangewakkerd, omdat informatie over de eiwitstructuur betere inzichten verschaft in het functioneren van eiwitten, waardoor betere geneesmiddelen kunnen worden ontwikkeld. Door het succes zijn er echter ook meerdere inefficiënties in de cryo-EM-workflow vastgesteld, vooral met betrekking tot staalvoorbereiding. Meerdere oplossingen werden reeds voorgesteld, maar deze nieuwe technieken zijn (i) vaak slechts een enkele stap binnen de algehele workflow, (ii) niet compatibel met andere nieuwe protocols/procedures of (iii) moeilijk te implementeren door non-expert gebruikers. In een vorige PoC-studie werd een nieuw type cryo-EM affiniteitsgrid ontwikkeld die het toelaat om eiwitten te immobiliseren en zuiveren. Op basis van marktbevraging werd vastgesteld dat het lanceren van deze grid het best gebeurt via eiwit-structuurbepaling diensten die gebruik maken van deze grid. Het doel van deze PoC is om nu enkele studies uit te voeren met therapeutisch relevante eiwitten, opdat de waarde van de grids en de verschillende technologieën kan worden aangetoond. Hierdoor zal de toegevoegde waarde van deze gridtechnologie nog beter in de markt gezet kunnen worden en aldus nog aantrekkelijker worden voor zowel potentiële klanten als investeerders.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Sterckx Yann

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Cruciale inzichten in cel- en ontwikkelingsbiologie zijn te danken aan technologie om levende cellen te visualiseren. Uit de groeiende complexiteit van cellulaire modellen en de precisie waarmee ze genetisch gemanipuleerd kunnen worden, volgt de nood aan meer geavanceerde microscopie. Kort samengevat vraagt modern, overkoepelend celonderzoek (ofte cellomica) lichtefficiënte, intelligente en interactieve beeldvormingsmethoden. Om deze gedeelde nood in te vullen, heeft ons consortium een innovatief platform geïdentificeerd dat snelle, minimaal invasieve visualisatie mogelijk maakt van kleine tot middelgrote stalen (cellen tot organoïden) aan hoge resolutie, zodat processen in beeld gebracht kunnen worden die reiken van voltage fluctuaties tot opeenvolgende celdelingen. Om enkel de relevante biologie te visualiseren – en daardoor ook een hogere doorvoer te verzekeren – is het systeem uitgerust met online beeldherkenning. En, om gerichte verstoringen mogelijk te maken, zoals lokale beschadiging of optogenetische activatie, kunnen kleine regio's selectief in het beeldveld belicht worden. Dankzij een dergelijke controle wordt het mogelijk om (sub-)cellulaire processen met ongekend detail te bestuderen. Het platform zal aangewend worden in verscheidene speerpuntonderzoeksvelden, waaronder neurowetenschappen, cardiovasculair onderzoek en infectieziekten, waardoor het een onmisbare aanwinst betekent voor de aanvragers, de microscopie kernfaciliteit en de Universiteit van Antwerpen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: De Vos Winnok
• Co-promotor: Caljon Guy
• Co-promotor: De Meyer Guido
• Co-promotor: Jordanova Albena
• Co-promotor: Rademakers Rosa
• Co-promotor: Timmerman Vincent
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Vissenberg Kris
• Co-promotor: Weckhuysen Sarah

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Digitale pathologie laat toe om volledige weefselcoupes aan hoge snelheid en hoge resolutie te fotograferen, om ze nadien direct te bekijken net zoals bij standaard microscopie. Niet enkel creëert deze toepassing een permanent archief van histologische coupes welke gemakkelijk met medewerkers gedeeld kunnen worden, een ander belangrijk aspect is de mogelijkheid tot snelle analyse, kwantificatie en pathologische interpretatie van volledige coupes, wat onmisbaar is in hedendaags preklinisch en klinisch onderzoek. Gezien deze toepassingen willen we binnen de UA een hoge-resolutie slidescanner aanschaffen, die tot op heden jammer genoeg nog niet aanwezig is aan de universiteit. Het kunnen beschikken over een dergelijk toestel zal niet alleen het onderzoek wezenlijk versnellen en bevorderen in de respectievelijke onderzoeksgroepen van de promotoren, maar in praktisch elke onderzoekgroep aan de UA die betrokken is met pre-klinisch of klinisch histopathologisch onderzoek. We zijn overtuigd dat de aanschaf van een hoge-resolutie digitale scanner voor histologische coupes onderzoeksgroepen verbonden aan UA zal helpen om bij te blijven in het competitief biomedisch onderzoeksveld, samenwerkingen tussen labo's, zowel intern als met externe academische partners, zal aanmoedigen en faciliteren, en extra inkomsten zal genereren door dienstverlening aan industriële partners.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Kumar-Singh Samir
• Co-promotor: Stroobants Sigrid
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Vervaet Benjamin

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het algemeen doel van dit project is om een geoptimaliseerd prototype te ontwikkelen van de totale lab-on-a-chip voor cryo- EM-oplossing: cryo-EM affiniteitsgrid plus microfluïdische chip. Specifiek, wordt een microfluïdische chip ontwikkeld die het zuiveren van biopartikels (i.e. proteïnes) mogelijk maakt en vervolgens een cryo-EM affiniteitsgrid kan laden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Van Putte Wouter

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Cryo-elektronenmicroscopie (cryo-EM) is de afgelopen vijf jaar enorm geëvolueerd, waardoor het een veelbelovende methode is geworden om structurele informatie te verkrijgen van therapeutisch relevante eiwitten betrokken bij kanker, bacteriële/virale infecties of neuropathologieën. Deze snelle evolutie heeft de interesse van farmaceutische bedrijven aangewakkerd, omdat informatie over de eiwitstructuur betere inzichten kan verschaffen in het functioneren van eiwitten, waardoor betere geneesmiddelen kunnen worden ontwikkeld. Door het succes, zijn er echter ook meerdere inefficiënties in de cryo-EM-workflow blootgesteld, vooral met betrekking tot samplevoorbereiding. Meerdere oplossingen werden reeds voorgesteld, maar deze nieuwe technieken (i) zijn vaak slechts een enkele stap binnen de algehele workflow, (ii) zijn niet compatibel met andere nieuwe oplossingen of (iii) zijn moeilijk te implementeren door non-expert gebruikers. Het doel van deze PoC-studie is om een nieuw type cryo-EM affiniteitsgrid te ontwikkelen, een elektronenmicroscopie grid die het toelaat om eiwitten te immobiliseren en zuiveren. De grid zal hierbij een essentiële consumable worden van een ander device dat ontwikkeld wordt door een internationaal initiatief dat is gericht op de ontwikkeling van een geïntegreerde workflow voor high-throughput cryo-EM.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Van Putte Wouter

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project website

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Ontwikkeling van nieuwe neuro-protectieve en/of immuun-modulerende therapeutische strategieën voor de meeste neurologische ziekten of traumata vereist, zowel voor academische onderzoekslaboratoria als voor farmaceutische industrie, het bestaan van betrouwbare in vitro celcultuurmodellen die ziekte-geassocieerde processen kunnen nabootsen. Helaas kan de complexe interactie tussen meerdere celtypes uit het centraal zenuwstelsel en meerdere celtypes afkomstig van het perifere immuunsysteem niet eenvoudig gesimuleerd worden gebruikmakende van twee-dimensionele (2D) celcultuurmodellen. Het is net hierdoor dat succesvolle preklinische therapieën zich heel moeilijk laten vertalen in een klinisch succes bij patiënten, met als extra gevolg dat de kloof tussen succesvolle labotherapieën en effectieve klinische vooruitgang steeds groter wordt. Een interessante nieuwe benadering ter verbetering van het predicatieve karakter van humaan in vitro neuro-immunologisch onderzoek bestaat uit de ontwikkeling van modulaire 3D hersenorganoïden die structureel, cellulair en functioneel overeenkomen met hersenweefsel. In het kader van dit project willen we een nieuwe methode ontwikkelen en valideren voor de generatie van isogene 3D hersenorganoïden, bestaande uit neuronen, astrocyten en microglia afgeleid van humane pluripotente stamcellen (hPSC). Bijkomend zullen hPSC-afgeleide astrocyten en endotheelcellen aangewend worden om een bloed-hersenbarrière model te genereren als fysische afscheiding tussen hPSC-afgeleide macrofagen en 3D hersenorganoïden. Dit geïntegreerde humaan 3D celcultuurmodel zal zo een innovatief en krachtig onderzoeksinstrument worden voor neuro-immunologisch onderzoek. In dit multidisciplinaire IOF-SBO project is de gebruikte methodologie voor de generatie van 3D hersenorganoïden, gecombineerd met klinische ervaring en de beschikbaarheid van patiëntenstalen, zeer uniek en zal – in eerste instantie – sterk bijdragen tot het domein van in vitro modellering van cerebrovasculaire aandoeningen en de validatie van mogelijke therapieën hiervoor. Bovendien zal, gegeven de huidige wetenschappelijke en economische relevantie, ons doel om aan de Universiteit Antwerpen een geïntegreerd platform voor 3D hersenorganoïden technologie te installeren leiden tot zowel intellectuele (doctoraten, A1 publicaties) als financiële (contractonderzoek) opbrengsten.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Ponsaerts Peter
• Co-promotor: De Vos Winnok
• Co-promotor: Jorens Philippe
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Wouters An

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Experimentele Hematologie (LEH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Naar schatting wordt 1 op de 9 mensen ouder dan 65 getroffen door de ziekte van Alzheimer (AD) en gezien de gestaag toenemende vergrijzing van de bevolking zal de prevalentie van AD alleen maar stijgen in de toekomst. Aangezien er nog steeds geen behandeling beschikbaar is die AD kan genezen en aangezien de diagnose van AD stoelt op de vaststelling van cognitieve achteruitgang in een laat stadium van de ziekte, is het uiterst belangrijk dat nieuwe medische toegangsroutes in een vroeg stadium worden onderzocht via origineel fundamenteel onderzoek. Recent verworven inzichten geven aan dat het maagdarmstelsel een kwetsbaar knooppunt vormt voor amyloïd-gedreven neurodegeneratie. Derhalve willen we de oorsprong, het verspreidingsgedrag en de routes waarlangs amyloïd-eiwitten ingang vinden in het enterisch zenuwstelsel definiëren. Via innovatieve beeldvormingstechnieken en doelgerichte moleculaire analyses willen we een nieuw licht werpen op de microbioom-darm-brein as die relevant is voor toekomstig (pre)klinisch onderzoek. Doordat de darmen een uniek, minimaal invasief venster vormen voor de diagnose van neuropathologische aandoeningen, kan ons werk de aanzet vormen tot de ontwikkeling van vroege biomerkers die rechtstreeks informatie leveren over de ziekteprogressie bij Alzheimer-patiënten. Bovendien kan een bevestiging van de these, dat microbiële amyloïden mogelijke triggers kunnen zijn voor tal van pathologieën, een paradigmaverschuiving teweegbrengen in de therapie voor AD.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: De Vos Winnok

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Sinds enkele jaren groeit het inzicht dat een ziekteproces dat het centrale zenuwstelsel (CNS) treft, ook zijn enterische tegenhanger (ENS) kan aantasten en vice-versa. Verschillende neurodegeneratieve aandoeningen gaan dan ook gepaard of worden zelfs voorafgegaan door gastro-intestinale dysfunctie. Dit verband werd al duidelijk aangetoond voor prionziekten en de ziekte van Parkinson, maar is nog niet doorgrond voor de ziekte van Alzheimer, een verwoestende neurodegeneratieve ziekte die wordt gekenmerkt door een progressieve cognitieve achteruitgang. Eén van de definiërende eigenschappen van AD is de opstapeling van verkeerd opgevouwen amyloïde-beta peptiden. Vermits het CNS en ENS sterk verbonden zijn, het darmmicrobioom amyloïden produceert die de polymerisatie van andere amyloïden kan enten, en inflammatie amyloïde-opstapeling kan bevorderen, is het aannemelijk dat de het gastro-intestinaal systeem een kwetsbaar knooppunt kan zijn voor amyloïde-gedreven degeneratie. De mechanismen die verantwoordelijk zijn voor de cellulaire verwerking van amyloïden in het ENS zijn echter ongekend. Daarom willen wij met dit onderzoeksproject de toegangsroutes, het spreidingsgedrag en de cellulaire effecten van bacteriële en gastheer-afgeleide amyloïden in het ENS karakteriseren. Door gebruik te maken van innovatieve microscopische technieken en goed gedefinieerde, moleculaire analysemethoden, zal dit werk bijdragen aan een verfijning van de 'gut-brain axis' theorie in de context van AD, en zal het ook nieuwe invalshoeken blootleggen voor fundamenteel en klinisch onderzoek, met relevantie voor een brede waaier aan proteopathische aandoeningen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: De Vos Winnok

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project omvat de aankoop van nieuwe SEM voor het bestuderen van oppervlaktestructuren van biomedische stalen ter vervanging van de uit 1987 daterende SEM 515. Dit apparaat laat toe samples zowel bij hoog als bij laagvacuum te bestuderen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Mas-gerelateerde G-proteïne gekoppelde receptoren (Mrgpr's) spelen een rol in sensorische processen, met inbegrip van jeuk en pijn. Voorgaande studies naar Mrgpr in intestinale inflammatie beschreven uitgebreide veranderingen in Mrgpr expressie, in het bijzonder in sensorische neuronen van het enterisch zenuwstelsel (ENS). Het feit dat de meeste Mrgpr nog geklasseerd zijn als "orphan receptoren", heeft de studie naar de functie en regulatie van deze receptoren bemoeilijkt. Dit project ontwikkelt nieuwe strategieën voor functionele studie van Mrgpr ondanks hun huidige "orphan" status en onderzoekt protease-gerelateerde activatiemechanismen van deze Mrgpr. MrgprE en MrgprF zijn daarbij in het bijzonder interessant gezien deze receptoren samen tot expressie komen in beide enterische plexussen (submucosaal en myenterisch), en co-gereguleerd zijn in Schistosoma mansoni en TNBS-geïnduceerde ileïtis modellen. Muis en humaan MrgprE en MrgprF zijn orthologen, en lopende studies met darmbiopten in ons laboratorium bevestigen expressie van MrgprE en MrgprF in het humane gastrointestinaal stelsel. Dit heeft ons aangezet tot de studie van de interactie tussen humaan (h-) MrgprE en MrgprF. Daarvoor maakten we gebruik van verschillende biofysische en biochemische technieken zoals een nieuwe luciferase complementatie techniek (NanoBit), bioluminiscentie resonantie energie transfer (BRET), fluorescentie resonantie energie transfer (FRET) en co-immunoprecipitatie (co-IP). De resultaten gaven concreet bewijs voor een heteromerizatie van h-MrgprE/h-MrgprF alsook een homomerizatie van h-MrgprE en h-MrgprF. In het laatste decennium is er een groeiend inzicht dat homo- en heteromerizatie van GPCRs de signaaltransductie, en daardoor cellulaire respons, kan moduleren. Desondanks laten de huidige biofysische methodieken alleen toe de oligomere toestand te detecteren, maar niet de affiniteit of competitie tussen de interagerende partners in de oligomerizatie te definiëren. Er is dus nood aan nieuwe protein-proteine interactie (PPI) methoden om deze affiniteit en competitie tussen GPCRs te evalueren. Met onze behaalde resultaten als basis, ontwikkelen we op dit moment een kwantitatieve NanoBit assay, die de huidige PPI methoden zal aanvullen en een beter inzicht zal verschaffen in affiniteit, competitie, biased agonisme en transiënte PPI.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Arora Rohit

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Deze applicatie beoogt de aanschaf van een innovatief microscopisch platform om levende cellen, weefselstalen en levende, kleinere modelorganismen in drie dimensies aan hoge snelheid en met uitstekende resolutie en contrast te visualiseren. Wat het systeem uniek maakt, is de light-sheet module. Deze is gebaseerd op een loodrechte opstelling van laser-gegenereerde, micrometer-fijne vlakbelichting en gevoelige one-shot opnames. Een naadloze integratie met de confocale microscoop maakt het mogelijk om eenzelfde staal in beeld te brengen van micro- tot mesoschaal. Het toestel heeft een brede applicatieradius in de neurowetenschappen, onder meer om neurodegeneratie en –regeneratie te bestuderen (bv. whole brain imaging, optogenetica), maar zal ook meteen van nut zijn in zeer uiteenlopende onderzoeksvelden zoals het cardiovasculair onderzoek (bv. plaquevorming en stabiliteit), plantbiologie (bv. proteïne lokalisatie tijdens plantgroei) en ecotoxicologie (bv. teratogeniciteit en ontwikkelingsdefecten in zebravis). Het modulaire karakter van het systeem, laat bovendien toe om snel in te spelen op wijzigende onderzoeksvragen door gerichte uitbreidingen mogelijk te maken.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Adriaensen Dirk
• Co-promotor: De Meyer Guido
• Co-promotor: De Vos Winnok
• Co-promotor: D'Haese Patrick
• Co-promotor: Giugliano Michele
• Co-promotor: Jordanova Albena
• Co-promotor: Keliris Georgios A.
• Co-promotor: Knapen Dries
• Co-promotor: Maudsley Stuart
• Co-promotor: Ponsaerts Peter
• Co-promotor: Timmerman Vincent
• Co-promotor: Vissenberg Kris

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

EGAMI staat voor Expert Group Antwerp Molecular Imaging en is het spiegelwoord van image. EGAMI clustert de internationaal erkende expertise in het domein van fundamentele en biomedische beeldvorming van vijf onderzoeksgroeps binnen de Universiteit Antwerpen: het het Bio-Imaging Lab, het Molecular Imaging Center Antwerp (MICA), de Radiology, het Laboratory for Cell Biology and Histology en het Vision Lab (voor post-bewerking van medische beelden). EGAMI's missie is om een geïntegreerd onderzoeksplatform aan te bieden dat alle aspecten van multi-modality translationeel medische beeldvorming omvat. Multi-modality verwijst naar de integratie van informatie van verschillende beeldvormingstechnieken. Binnen EGAMI is er preklinische en klinische expertise en infrastructuur voor magnetic resonance imaging (MRI), computed tomography (CT), positron emission tomography (PET) en single-photon emission computed tomography (SPECT). EGAMI heeft projecten i.v.m. toegepast biomedisch (beeldvormings)onderzoek en fundamenteel onderzoek naar beeldvormingsmethodologie. Het toegepaste biomedische onderzoek focust op de onderzoeksgebieden neuro(bio)logie (o.a. de ontwikkeling en validatie van biomarkers (en therapie evaluatie) voor de ziekte van Alzheimer, schizofrenie, multiple sclerose enz.) en op oncologie (o.a. biomarkers voor betere patiënt stratificatie en therapie monitoring). Aangezien het preklinische biomedische onderzoek van EGAMI maakt gebruik van geminiaturiseerde versies van humane beeldvormingsapparatuur (scanners) is het inherent translationeel, m.a.w. initiële bevindingen in proefdieren kunnen vertaald worden naar klinische toepassingen voor verbeterde diagnose en behandeling van patiënten ('from bench to bedside'). Naast de toepassing van beeldvorming in biomedisch onderzoek heeft EGAMI ook projecten die verbetering en optimalisatie van de beeldvormingsmethodologie beogen. De expertise van de MICA (m.b.t. de ontwikkeling van nieuwe radiotracers) en van Visielab (m.b.t. de ontwikkeling van beeldreconstructie, segmentatie en analyse algoritmes) bieden hierbij mogelijkheid voor de strategische opbouw van intellectuele eigendom.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Der Linden Annemie
• Co-promotor: Parizel Paul
• Co-promotor: Sijbers Jan
• Co-promotor: Staelens Steven
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Guns Pieter-Jan
• Mandaathouder: Lanens Dirk
• Mandaathouder: Van Putte Wouter

Onderzoeksgroep(en)

• Bio-imaging lab

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds VITO. UA levert aan VITO de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De missie van het "ExpertiseCentrum O&O Monitoring" (verder afgekort: ECOOM) bestaat erin een performant systeem van O&O- en innovatie-indicatoren te ontwikkelen en te onderhouden dat de Vlaamse overheid moet voorzien van geactualiseerde en relevante statistische data met betrekking tot de O&O- en innovatieperformantie van de Vlaamse regio. Tevens ontwikkelt ECOOM een portefeuille van relevante wetenschappelijke onderzoeksactiviteiten ter ondersteuning van deze missie. Daartoe: (1) voert het ECOOM een reeks gerichte lange termijn opdrachten en takenpakketten uit die het Vlaams O&O- en innovatiepotentieel in kaart brengen, kwantificeren en analyseren, (2) dient het erover te waken dat de Vlaamse overheid over een geschikte databeheersstructuur kan beschikken betreffende bibliometrische gegevens, technometrische data, innovatiegegevens en doctoraatsgegevens, (3) bouwt het een gekwalificeerde staf uit, (4) bouwt het de nodige originele IT-infrastructuur uit, en (5) verzorgt het "ad hoc" opdrachten en projecten op aanvraag voor de Vlaamse overheid. ECOOM opereert als een inter-associatie expertisecentrum.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Engels Tim
• Co-promotor: Blust Ronny
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project website

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek-Vlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Buckinx Roeland

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds een privé-instelling. UA levert aan de privé-instelling de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De middelen worden toegekend voor activiteiten met betrekking tot de omkadering en begeleiding van jonge onderzoekers. De subsidie wordt ingezet voor het creëren van een kader voor en de ontwikkeling, uitvoering en versterking van activiteiten met betrekking tot de volgende objectieven: Training van jonge onderzoekers; Loopbaanontwikkeling en bevordering van loopbaanperspectieven van jonge onderzoekers; Versterken van de internationale oriëntatie in de loopbaan van jonge onderzoekers."

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek-Vlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Dedeurwaerdere Stefanie
• Co-promotor: Staelens Steven
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Van Der Linden Annemie

Onderzoeksgroep(en)

• Translationele Neurowetenschappen (TNW)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek-Vlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Vrints Christiaan
• Co-promotor: Claeys Marc
• Co-promotor: De Meyer Guido
• Co-promotor: Martinet Wim
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek-Vlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Adriaensen Dirk
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht toegekend door de Universiteit Antwerpen. De promotor levert de Universiteit Antwerpen de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd door de universiteit.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Der Linden Annemie
• Co-promotor: Adriaensen Dirk
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: De Visscher Geofrey
• Mandaathouder: Guns Pieter-Jan

Onderzoeksgroep(en)

• Bio-imaging lab

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht toegekend door de Universiteit Antwerpen. De promotor levert de Universiteit Antwerpen de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd door de universiteit.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds IWT. UA levert aan IWT de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Del-Favero Jurgen
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het projectheeft als doel de volledige karakterisatie en optimalisatie van neuronale celcultuursystemen in eerste instantie in wild-type muizen en vervolgens in transgene diermodellen voor neurodegeneratieve ziekten zoals dementie en schizofrenie. In deze celculturen worden, door de ziektes geynduceerde, fenotypische veranderingen opgevolgd en worden mogelijke farmaca voor de behandeling ervan getest.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Verstraelen Peter

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De doelstelling van het voorgestelde project is om na te gaan hoe de verschillende homing signalen uitgezonden door ischemisch weefsel, via inductie van de PI3K/Akt/eNOS pathway, EPCs aanzetten tot de expressie van cellulaire adhesiemoleculen waardoor een efficiënte homing, adhesie en diapedese mogelijk is.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Vrints Christiaan
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Everaert Bert

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De missie van het "ExpertiseCentrum O&O Monitoring" (verder afgekort: ECOOM) bestaat erin een performant systeem van O&O- en innovatie-indicatoren te ontwikkelen en te onderhouden dat de Vlaamse overheid moet voorzien van geactualiseerde en relevante statistische data met betrekking tot de O&O- en innovatieperformantie van de Vlaamse regio. Tevens ontwikkelt ECOOM een portefeuille van relevante wetenschappelijke onderzoeksactiviteiten ter ondersteuning van deze missie. Daartoe: (1) voert het ECOOM een reeks gerichte lange termijn opdrachten en takenpakketten uit die het Vlaams O&O- en innovatiepotentieel in kaart brengen, kwantificeren en analyseren, (2) dient het erover te waken dat de Vlaamse overheid over een geschikte databeheersstructuur kan beschikken betreffende bibliometrische gegevens, technometrische data, innovatiegegevens en doctoraatsgegevens, (3) bouwt het een gekwalificeerde staf uit, (4) bouwt het de nodige originele IT-infrastructuur uit, en (5) verzorgt het "ad hoc" opdrachten en projecten op aanvraag voor de Vlaamse overheid. ECOOM opereert als een inter-associatie expertisecentrum.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht toegekend door de Universiteit Antwerpen. De promotor levert de Universiteit Antwerpen de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd door de universiteit.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: De Groote Chantal
• Co-promotor: De Meyer Guido
• Co-promotor: Timmerman Vincent
• Co-promotor: Van Marck Eric
• Co-promotor: Verbelen Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het onderzoeksproject behelst ondermeer in vitro electrofysiologie en patch clamp opnamen op rattenhersenen, dit met behulp van theoretische technieken en computationele modeling ter ondersteuning van experimenteel onderzoek, data analyse en interpretatie.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Giugliano Michele

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het doel van dit project is na te gaan (1) of naast UCN1 en CST, ook SRF, UCN2 en UCN3 anti-inflammatoire effecten hebben op intestinale inflammatie; (2) wat enerzijds het effect is van deze neuropeptiden op de neuro-immuuninteractie tijdens inflammatie, en anderzijds het belang van dit effect in de therapeutische werking van deze neuropeptiden; en (3) welke receptoren hierbij effectief betrokken zijn.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Van Nassauw Luc

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project website

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het doel van dit TOP-BOF-project bestond erin de bidirectionele communicatie tussen het enterisch zenuwstelsel (EZS) en het immuunstelsel te bestuderen in intestinale inflammatoire modellen, nl. acute intestinale schistosomiasis, TNBS-geinduceerde ileïtis en bij uitbreiding acuut en chronisch alcohol-misbruik. deze interactie blijkt een belangrijke rol te spelen in de inflammatoire respons en kan mogelijks een beter inzicht bieden in de onderliggende mechanismen van de waargenomen hyperexciteerbaarheid van afferente zenuwbanen binnen het enterisch zenuwstelsel tijdens gastrointestinale inflammatie. Speciale aandacht zal in dit project uitgaan naar cortistatinen en urcortinen alsook naar Mas-related gene receptoren.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Adriaensen Dirk

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

1.Identificatie en topografische lokalisatie van somatostatine receptoren in het EZS van niet-geïnflammeerd muizenileum middels immunohistochemie en reverse transcriptase-PCR. De somatostatine receptor bevattende neuronen worden neurochemisch gekarakteriseerd m.b.v. multipele immunofluorescente kleuringen. 2.Vergelijking van de identiteit en het expressiepatroon van somatostatine receptoren in enterische neuronen in 8 weken Schistosoma mansoni geïnfecteerde muizen met niet-geïnflammeerd ileum, gebruik makend van Real Time RT-PCR. 3. Optimalisatie van het protocol voor isolatie van mucosale mestcellen uit de lamina propria van 8 weken Schistosoma mansoni geïnfecteerde muizen 4. Identificatie en kwantificatie van somatostatine receptoren op in vitro ontwikkelde mucosale mestcellen en mucosale mestcellen geïsoleerd uit de lamina propria van 8 weken geïnfecteerde muizen, gebruik makend van immunohistochemie reverse transciptase-PCR en Real Time RT-PCR. Deze resultaten worden in vivo bevestigd door immunofluorescente detectie van somatostatine receptoren op mucosale mestcellen in de GIT van Schistosoma mansoni geïnfecteerde muizen. 5.Studie van een eventueel compensatie-effect van somatostatine receptor type 2 deficiëntie op de identiteit en het expressieniveau van de somatostatine receptoren in enterische neuronen en mucosale mestcellen aan de hand van immunohistochemie, reverse transcriptase PCR en Real Time RT-PCR. 6.Studie van het effect van toediening van SOM en SOM analogen op de synthese en secretie van inflammatoire mediatoren door mucosale mestcellen met cDNA microarray en ELISA 7.Functionele studie van het effect van somatostatine op de neuro-immuuninteractie tussen mestcellen en enterische neuronen, gebruik makend van mucosale mestcellen en enterische neuronen geïsoleerd uit de GIT van Schistosoma mansoni geïnfecteerde muizen. Live cell imaging en multifotonmicroscopie worden gebruikt om de activiteit van beide celtypes na SOM-stimulatie te onderzoeken.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Van Op den bosch Joeri

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De doelstelling van het voorgestelde project is om na te gaan hoe de verschillende homing signalen uitgezonden door ischemisch weefsel, via inductie van de PI3K/Akt/eNOS pathway, EPCs aanzetten tot de expressie van cellulaire adhesiemoleculen waardoor een efficiënte homing, adhesie en diapedese mogelijk is.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Vrints Christiaan
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Everaert Bert

Onderzoeksgroep(en)

Project website

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Vrints Christiaan
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Everaert Bert

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De core faciliteit "Microscopische Biomedische Beeldvorming" zal kunnen voorzien in materiaal, kennis en vaardigheden aangaande verschillende soorten microscopische toepassingen, en zal histologisch en beeldvorminggerelateerde ondersteuning kunnen verlenen aan onderzoekers en studenten verbonden aan de Universiteit Antwerpen en daarbuiten.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Specifieke doelstellingen van het project : 1) Detectie van 'silent' Kv subeenheden in het hart en hun rol bij de traag inactiverende 'delayer rectifier current' bestuderen; 2) Transgene analyse van de fysiologische rol van 'silent' subeenheden; 3) Is de interactie tussen Kv1.5 en KChIP een stabiele interactie en wat zijn de functionele gevolgen? 4) Wat zijn de moleculaire determinanten van de interactie tussen Kv1.5 en KChIP subeenheden ?

Onderzoeker(s)

• Promotor: Snyders Dirk
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Portale hypertensie is een gevreesde complicatie van cirrose en wordt gekenmerkt door een verhoogde druk in de vena portae, wat kan leiden tot een aantal ernstige verwikkelingen zoals bloeding uit slokdarm- en maagvarices, ascites, encefalopathie, etc. Portale hypertensie wordt gedeeltelijk veroorzaakt door actieve contractie van leverstellaatcellen. Deze cellen worden dan ook aanzien als doelcellen voor de behandeling van porta Ie hypertensie. De exacte meehanismen van leverstellaatceleontraetie is niet volledig gekend. Daar waar de contractielrelaxatie van gladde spiercellen voornamelijk bepaald wqrdt door veranderingen in intracellulair Ca2+([Ca2+]j) , wordt de contractilteit van niet-spiercellen voornamelijk geregeld door de RhoA signaaltransductie. Het staat vast dat beide mechanismen betrokken zijn in LSC contractiliteit, maar het is nog niet geweten welk van de twee mechanismen een grotere rol speelt. Opdat een eel contractiele kraehten zou kunnen overbrengen zijn er 2 voorwaarden: een stevig eytoskelet en verankering met de extracellulaire matrix. In skeletale spiercellen is het dystrophine­geassocieerd prote"ine complex (DAPC) de fysische link tussen de extracellulaire matrix en actine­myosine filamenten enerzijds en de Intermediaire filamenten die synemine, syncoiline en desmine bevattenen anderzijds. Bovendien zou het DAPC ook een functionele rol kunnen spelen in de signaaltransductie van contractiliteit. Het doel van dit onderzoek is meer inzicht te verwerven in de mechanismen die leiden tot contractie van leverstellaatcellen, en meer bepaald de rol die het DAPC hierin speelt. Hiervoor zullen er verschillende aspeeten verder onderzocht worden: - expressie en interactie van DAPC in LSC bij de muis en de mens. - de rol van DAPC en geassocieerde eiwitten in de contractiliteit van LSC. - Relatieve rol van [Ca2+]j en RhoA bij de contractie van LSC in normale en cirrhotische muizen en muizen met mutaties in het DAPC. - het identificeren van myosines in quiescente en geactiveerde leverstellaatcellen bij muis en mens, en dit zowel 02 mRNA als eiwitniveau.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Vrints Christiaan
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

1.Identificatie en topografische lokalisatie van somatostatine receptoren in het EZS van niet-geïnflammeerd muizenileum middels immunohistochemie en reverse transcriptase-PCR. De somatostatine receptor bevattende neuronen worden neurochemisch gekarakteriseerd m.b.v. multipele immunofluorescente kleuringen. 2.Vergelijking van de identiteit en het expressiepatroon van somatostatine receptoren in enterische neuronen in 8 weken Schistosoma mansoni geïnfecteerde muizen met niet-geïnflammeerd ileum, gebruik makend van Real Time RT-PCR. 3. Optimalisatie van het protocol voor isolatie van mucosale mestcellen uit de lamina propria van 8 weken Schistosoma mansoni geïnfecteerde muizen 4. Identificatie en kwantificatie van somatostatine receptoren op in vitro ontwikkelde mucosale mestcellen en mucosale mestcellen geïsoleerd uit de lamina propria van 8 weken geïnfecteerde muizen, gebruik makend van immunohistochemie reverse transciptase-PCR en Real Time RT-PCR. Deze resultaten worden in vivo bevestigd door immunofluorescente detectie van somatostatine receptoren op mucosale mestcellen in de GIT van Schistosoma mansoni geïnfecteerde muizen. 5.Studie van een eventueel compensatie-effect van somatostatine receptor type 2 deficiëntie op de identiteit en het expressieniveau van de somatostatine receptoren in enterische neuronen en mucosale mestcellen aan de hand van immunohistochemie, reverse transcriptase PCR en Real Time RT-PCR. 6.Studie van het effect van toediening van SOM en SOM analogen op de synthese en secretie van inflammatoire mediatoren door mucosale mestcellen met cDNA microarray en ELISA 7.Functionele studie van het effect van somatostatine op de neuro-immuuninteractie tussen mestcellen en enterische neuronen, gebruik makend van mucosale mestcellen en enterische neuronen geïsoleerd uit de GIT van Schistosoma mansoni geïnfecteerde muizen. Live cell imaging en multifotonmicroscopie worden gebruikt om de activiteit van beide celtypes na SOM-stimulatie te onderzoeken.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Van Op den bosch Joeri

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Doel van deze studie is de morfologische, electrofysiologische en neurofarmacologische identifikatie van de rol, mechanismes en de effekten van de bi-direktionele interakties tussen het enterale zenuwstelsel en het enterale immuunsysteem op het funktioneren van het maagdarmkanaal onder (patho)fysiologische omstandigheden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Kroese Alfons

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project gebruikt de gecombineerde technische expertise van de drie onderzoeksgroepen om drie onderzoekstopics te bestuderen: het cerebellum, het enterisch zenuwstelsel en kaliumkanalen. Specifiek worden de indeling van neuronen in korrelcellaag, kaliumkanalen in Purkinje-cellen en hun inhibitie van de diepe kernen onderzocht, alsook expressie van kaliumkanalen in viscerosensorische neuronen en veranderingen ervan onder invloed van inflammatorische mediatoren vrijgesteld door mestcellen en de expressie en functie van 5 nieuwe subeenheden van kaliumkanalen in de hersenen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: De Schutter Erik
• Co-promotor: Snyders Dirk
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Van Marck Eric

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

PARs zijn eenvan de mogelijke sensorisch neuron- specifieke moleculaire doelwitten die bruikbaar kunnen zijn bij de therapeutische behandeling van een aantal inflammatoire darmaandoeningen. Dit project wil de rol achterhalen die deze receptoren spelen bij de neuro-immuuninteracties tussen mestcellen en de afferente component van het enterisch zenuwstelsel in het schistosomiasis-inflammatiemodel.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Meir Frans
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Blust Ronny
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: De Jonge Frederik

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Van Nassauw Luc

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Schryvers Nick
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Bedoeling van deze studie is de morfologische en electrofysiologische karakterisatie van de intrinsieke sensorische neuronen en van hun specifieke pathways naar intrinsiek inter-en/of motor neuronen door middel van optische multi-site registratie na chemische of mechanische stimulatie.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

In het morfologisch luik van dit project zal met behulp van immunocytochemische technieken de cellulaire lokalisatie en het expresssiepatroon van het DFNA5 gen product nagegaan worden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De voornaamste doelstellingen van dit project zijn de studie van 1. de correlatie tussen morfologische en fysiologische karakteristieken van intrinsieke slokdarmneuronen en 2. de rol van de aanwezigheid van interstitiële cellen van Cajal in dit deel van de tractus digestivus.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Adriaensen Dirk

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: De Jonge Frederik

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De bedoeling van deze studie is enerzijds het bekomen van een gedetailleerde morfologische beschrijving van corticocerebellaire Golgi-cellen met inbegrip van de verschillende synaptische inputs op deze cellen (en dit zowel in 2D als in 3D) en anderzijds het bestuderen van de relatie tussen de Golgi-cel morfologie en de rest van de cerebellaire schors.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Geurts Frederik

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Complementair aan de klassieke intracellulaire registratiemethode zal met behulp van de tweefotonmicroscoop en met specifieke C++-indicatoren en/of membraanpotentiaal gevoelige fluorescente stoffen getracht worden de activiteit van neuronen binnen enterische microcircuits zichtbaar te maken na applicatie van mechanische, elektrische en chemische stimuli.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Ondanks de eenvoudige en zeer regelmatige anatomische structuur van het cerebellum blijven de functie en werking ervan nog steeds onduidelijk. Dit project beoogt om door een combinatie van computersimulaties en experimenten in mens en proefdier de werking van het cerebellum beter te begrijpen. Hiervoor zal gebruik gemaakt worden van morfologische en electrofysiologische technieken in de rat en functionele magnetische resonantie beeldvorming van mens en rat.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Der Linden Annemie
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Bio-imaging lab

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Door middel van visualisatie en registratie van membraanpotentiaal- en/of intracellulaire Ca2+-veranderingen zal getracht worden de spreiding van de excitatie van enterische neuronen te analyseren en de differentiële activatie van verschillende enterische neuronenpopulaties door specifieke stimuli te bepalen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

RAFO-Financiering voor de aankoop van een mesmaker voor het maken van glazen messen voor het snijden van ultradunne coupes met de ultramicrotoom.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het doel van deze studie is tweeledig: 1. Door middel van carbocyanine tracing intrinsieke pathways in het enterisch zenuwstelsel van het varken en de mens identificeren en analyseren. 2. Het op punt stellen van een dissociatietechniek voor enterische neuronen bij grote huisdieren om aldus electrofysiologische eigenschappen van verschillende, middels DiI geïdentificeerde functionele neuronenklasses, te bestuderen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De studie van de neuro-endocriene regulatie van de viscerale functies, die het onderwerp uitmaakte van het vorige project, zal verder gezet worden, maar het accent zal verschoven worden naar de verstoring van deze regulatiemechanismen door intestinale ontsteking. Hierbij zal vooral de aandacht toegespitst worden op de relatie tussen inflammatoire mediatoren en het ENS bij colitis en Schistosoma-infectie.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor celbiologie en histologie

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

In dit project wordt de relatie tussen morfologie en fysiologie van het neuron op drie niveaus en in twee neuronale systemen (cerebellum en enterisch systeem) bestudeerd. Wij zullen onderzoeken wat het belang van de morfologie van cellen is voor de classificatie van verschillende neuronen en wat het effect ervan is op het metabolisme van second messengers, op het vuurgedrag van neuronen en op het gedrag van netwerken. De reconstructie van morfologieën gebeurt in samenwerking tussen de twee onderzoeksgroepen, terwijl de te bestuderen neurale systemen de fysiologische methodes bepalen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: De Schutter Erik
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De bedoeling van deze studie is enerzijds het bekomen van een gedetailleerde morfologische beschrijving van corticocerebellaire Golgi-cellen met inbegrip van de verschillende synaptische inputs op deze cellen (en dit zowel in 2D als in 3D) en anderzijds het bestuderen van de relatie tussen de Golgi-cel morfologie en de rest van de cerebellaire schors.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Geurts Frederik

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Met behulp van een recente tracertechniek in orgaancultuur in combinatie met immunocytochemische en in situ hybridisatie technieken, zal de invloed van schistosomiase op de intrinsieke component van het enterisch zenuwstelsel, i.e. op het verloop van de intrinsieke zenuwbanen en op de neurochemische eigenschappen van de neuronen, evenals op de expressie van verschillende cyto- en chemokinen in niet-neuronale cellen, morfologisch geanalyseerd worden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Nassauw Luc
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Immunohistochemische en in situ hybridisatie studie van de bezenuwing van de darm bij de muis onder normale en in inflammatoire omstandigheden

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Mandaathouder: Van Nassauw Luc

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

RAFO-Cofinanciering van de aankoop van een ultramicrotoom met vriesinrichting voor het aantrimmen van weefselstukjes, het maken van ultradunne coupes en ultradunne vriescoupes voor onderzoek in een transmissie-elektronenmicroscoop en van semi-dunne coupes en semi-dunne vriescoupes voor lichtmicroscopisch onderzoek.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Gebruik makend van zogenaamde "fluopeptiden" wordt niet alleen getracht om het distributiepatroon van verschillende neuropeptiden-receptoren in de gastro-intestinale tractus na te gaan, maar ook de kinetiek van deze receptoren onder welbepaalde experimentele omstandigheden te bestuderen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Adriaensen Dirk
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Na het identificeren van de sequentie van motiline zullen in het konijn antilichamen opgewekt worden teneinde door middel van immunocytochemie de cellen die motiline bevatten in kaart te brengen. Naast de topografische lokalisatie zullen de neurochemische kenmerken bepaald worden van neuronen-populaties die over receptoren voor motiline beschikken. Daarnaast zullen de centrale effecten bestudeerd worden door middel van functionele MRI na intraventriculaire injecties van motiline en motilides.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Met behulp van een recente tracertechniek in orgaancultuur in combinatie met immunocytochemische kleuringen zal getracht worden een verdere identificatie door te voeren van primaire afferente enterische neuronenpopulaties bij grote mammalia.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit netwerk heeft als doel de neuro-endocriene interacties in verschillende segmenten van de maag-darmtractus te bestuderen vanuit een functioneel-morfologisch en farmacologisch oogpunt. In de eerste plaats zal gefocuseerd worden op het enterisch zenuwstelsel en de relatie met de specifieke targets (enterocyten, endocriene cellen, neuronen, spiervezels). Het luik van dit labo omvat de neurochemische en electrofysiologische karakterisering van de verschillende enterische neuronenpopulaties.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

In situ hybridisatie gebruik makend van niet-radioactief gelabelde mRNA of oligonucleotidesprobes, wordt aangewend om een beter inzicht te verkrijgen in het panel van bioactieve stoffen dat aangemaakt kan worden door de neuroepitheliale endocriene cellen in het ademhalingsstelsel bij vertebraten.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Adriaensen Dirk

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

1) Enterische neurontypen worden morfologisch geidentificeerd na intracellulaire markering; hun synaptische input onder normale omstandigheden wordt gekwantificeerd; 2) Zij worden morfologisch gekarakteriseerd bij inflammatoire darmaandoeningen en experimenteel geinduceerde parasitaire ontstekingsprocessen in de darmwand; 3) Studie van de extracellulaire matrix en haar rol in celmigraties; 4) Postnatale ontwikkeling van de pulmonale acinus.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre
• Co-promotor: Harrisson Fernand
• Co-promotor: Van Meir Frans

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project omvatte de studie van de neuro-endocriene regulatiemechanismen van viscerale functies waarbij nadruk gelegd werd op: a) de niet-adrenerge, niet-cholinerge (NANC) component van het enterische zenuwstelsel; b) het werkingsmechanisme van motiline; en c) de relatie motiliteit-inflammatie.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Gebruikmakend van immunocytochemische technieken en tracer technieken wordt getracht de afferente zenuwbanen die instaan voor de signaaloverdracht van de darm naar het centrale zenuwstelsel topografisch en neurochemisch te identificeren.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Scheuermann Dietrich
• Co-promotor: Timmermans Jean-Pierre

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject