Onderzoeksgroep
Expertise
Als wetenschappelijk onderzoeksmanager van het Infla-Med Onderzoeksexcellentie consortium (OEC) verken ik voortdurend innovatieve en multidisciplinaire onderzoekssamenwerkingen binnen en buiten het consortium. Hiervoor identificeer ik financieringsmogelijkheden en ondersteun ik het proces van het schrijven van nieuwe fundamentele en toegepaste preklinische onderzoeksvoorstellen voor het Infla-Med consortium. Ik ben ook betrokken bij het projectmanagement van grote internationale projecten (MSCA-ITN, ERA.Net, IMI,....). Het Infla-Med Onderzoeksexcellentie consortium aan de Universiteit Antwerpen voert fundamenteel en translationeel onderzoek naar doelwitten voor de behandeling van ontstekingsziekten door middel van een multidisciplinaire aanpak.
Ontwikkeling van de eerste 'druglike' Granzyme B liganden, bepaling van hun bindingsmodus en implementatie als activiteitsgebaseerde probes voor Positron Emissie Tomografie (PET) beeldvorming.
Abstract
Granzyme B (GRZB) is het meest voorkomende protease dat aanwezig is in de granules van cytotoxische immuuncellen en speelt een sleutelrol bij het gericht doden van kankercellen door het immuunsysteem. In tumoren is de hoeveelheid GRZB die wordt uitgescheiden door geactiveerde immuuncellen omgekeerd evenredig met de mate van immuunsuppressie. Daarom wordt GRZB gekwantificeerd in tumorbiopten van patiënten die worden behandeld met immuuncheckpointremmers. Bovendien wordt er veel onderzoek gedaan naar de ontdekking van Positron Emissie Tomografie (PET)-probes die een minimaal-invasieve beeldvorming van GRZB mogelijk maken. Deze benadering is ook relevant voor CAR T- en CAR NK-celtherapie, waarbij de hoeveelheid vrijgekomen GRZB correleert met de therapierespons. Binnen een Marie Curie Doctoraal Netwerk 'OncoProTools' doen we onderzoek naar nieuwe op GRZB activiteit gebaseerde probes. De aangeworven postdoc zal hier op de volgende manieren aan bijdragen: (i) Productie en opzuivering van GrzB via een eigen recombinant expressiesysteem; (ii) Structurele biologie: opheldering van de structuur van 3 [GRZB-probe] co-complexen en bepaling van de sondebindingsmodi via macromoleculaire röntgenkristallografie; (iii) Kinetische karakterisering van de probes: bepaling van bindingsparameters via jump-dilution assays, progress curve analyse, uiteindelijk gecombineerd met grating-coupled interferometrie; (iv) Synthese van geoptimaliseerde probes: Bereiding van verder geoptimaliseerde GRZB probes.Onderzoeker(s)
- Promotor: Van Der Veken Pieter
- Co-promotor: Berg Maya
- Co-promotor: De Meester Ingrid
- Co-promotor: De Winter Hans
- Co-promotor: Elvas Filipe
- Co-promotor: Sterckx Yann
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Ontwikkeling en synthese van metacaspase inhibitoren als potentiële lead verbindingen voor antiparasitaire chemotherapeutica.
Abstract
Het onderzoek spitst zich toe op een cysteïne protease van Trypanosoma brucei, het metacaspase (MCA), waarvan de functie tot vandaag grotendeels onbekend blijft. Dit MCA werd reeds als doelwit gevalideerd, maar tot op heden zijn nog geen MCA inhibitoren gekend. Het project legt zich toe op een rationeel design en synthese van inhibitoren zodat op termijn een structuur-activiteitsrelatie kan worden opgesteld. In een later stadium wordt toegespitst op optimalisatie van de bekomen inhibitoren. Het einddoel is één of meerdere inhibitoren met een hoge activiteit, met selectiviteit tegenover de humane caspasen en met een voldoende chemische stabiliteit te ontwikkelen.Onderzoeker(s)
- Promotor: Augustyns Koen
- Mandaathouder: Berg Maya
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Synthese en biologische evaluatie van nucleoside hydrolase inhibitoren als trypanocide verbindingen.
Abstract
Het project onderzoekt een nieuw doelwit in het onderzoek naar trypanocide geneesmiddelen. Het maakt deel uit van een project over de therapeutische mogelijkheden van het enzym "nucleoside hydrolase" (NH), uitgevoerd door onze onderzoeksgroep en de onderzoeksgroep "Ultrastructuur" van de VUB (Prof. J. Steyaert). NH splitst de N-glycosidische binding van nucleosiden en maakt deel uit van de "salvage pathway", verantwoordelijk voor de biosynthese van purine nucleotiden. Het project kadert in de validatie van dit enzym als doelwit bij de ontwikkeling van antiparasitaire verbindingen en spitst zich toe op trypanosomaal NH. NH lijkt een aantrekkelijk doelwit in de ontwikkeling van trypanocide verbindingen: o de "purine salvage pathway" is essentieel voor het overleven van trypanosoma. (El Kouni, M.H., Pharmacology & Therapeutics, 2003, 99, 283) o NH komt niet voor bij mammalia. o NH komt wel voor bij bacteriën maar de "purine salvage pathway" is daar niet essentieel.Onderzoeker(s)
- Promotor: Augustyns Koen
- Co-promotor: Haemers Achiel
- Mandaathouder: Berg Maya
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Serine proteasen als doelwit voor antiparasitaire geneesmiddelen.
Abstract
Het voorgestelde project onderzoekt nieuwe "targets" in het onderzoek naar anti-protozoaire middelen. Ons laboratorium heeft een langdurige ervaring in de ontwikkeling van inhibitoren van proteasen. In een reeks onderzoeksprojecten worden nieuwe inhibitoren ontwikkeld voor Plasmodia en Trypanosoma-Leishmania specifieke serine- en cysteine proteasen en wordt nagegaan of deze proteasen goede doelwitenzymen zijn. Dit project spitst zich toe op twee serine proteasen : een dipeptidylprolylaminopeptidase (DPP) en een nog niet nader bepaald endoprotease met "sheddase" activiteit.Onderzoeker(s)
- Promotor: Augustyns Koen
- Mandaathouder: Berg Maya
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject