Onderzoek Paul Cos

Abstract

Mycobacterium abscessus (Mab) is een niet-tuberculose mycobacterium (NTM) die opportunistische infecties veroorzaakt bij patiënten met chronische longziekten, zoals mucoviscidose en chronische obstructieve longziekte. Infecties met Mab zijn moeilijk te behandelen omdat het een hoge resistentie tegen antibiotica vertoont en de correlatie tussen de in vitro gevoeligheid van Mab-isolaten en de klinische uitkomst beperkt is. Voor Mab-longziekten is de rol van antibioticatolerante persisters in ziekte en behandeling niet vastgesteld. Gezien het chronisch karakter van de ziekte, evenals de lange duur van de behandeling en het frequent optreden van terugval, veronderstellen we dat persistentie van groot belang is. Door de multidisciplinaire expertise van LMPH (UA) en het BREATHE/Microbiologie lab (UZ/KUL) te combineren, zal dit project fundamentele kennis opleveren over i) de frequentie van persistervorming in verschillende klinische Mab isolaten onder klinisch relevante omstandigheden voor verschillende antibioticaklassen; ii) het mechanisme achter antibiotica-geïnduceerde persistervorming en iii) het belang van persisters in ziekteprogressie en succes van de behandeling. We zijn ervan overtuigd dat een grondig begrip van de mechanismen die betrokken zijn bij persistervorming zal helpen bij de identificatie van potentiële nieuwe doelwitten voor geneesmiddelen die kunnen inwerken op persistente Mab, wat uiteindelijk zal leiden tot betere behandelingsmogelijkheden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Mycobacterium abscessus (Mab) is een opkomende ziekteverwekker die verantwoordelijk is voor een breed spectrum van ziekten, waaronder chronische longziekten en huidinfecties. De behandeling van Mab-infecties is een grote uitdaging omdat het een hoge resistentie tegen antibiotica bezit en de correlatie tussen de in vitro gevoeligheid van Mab-isolaten en de klinische uitkomst beperkt is. Voor Mab long infecties is de rol van persisters in ziekte en behandeling nog niet vastgesteld. Gezien het chronisch karakter van de ziekte, evenals de lange duur van de behandeling en het frequent optreden van terugval, veronderstellen we dat persistentie van groot belang kan zijn. Dit project heeft als doel de fundamentele kennis over persistentie van Mab te vergroten, zoals de frequentie van persistervorming voor verschillende antibioticaklassen in verschillende Mab-isolaten onder standaard en klinisch relevante condities evenals de moleculaire mechanismen die betrokken zijn bij persistervorming. Aangezien Mab zich kan repliceren in macrofagen, zullen de persistentieniveaus van Mab in een intracellulaire omgeving ook bepaald worden. We zijn ervan overtuigd dat een grondig begrip van de mechanismen die betrokken zijn bij de vorming van persisters zal helpen bij de identificatie van potentiële nieuwe doelwitten voor geneesmiddelen die kunnen inwerken op persistente Mab, wat uiteindelijk zal leiden tot betere behandelingsmogelijkheden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Mandaathouder: Geerts Lisa

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Streptococcus pneumoniae (SP) is een belangrijke oorzaak van longontstekingen opgelopen buiten het ziekenhuis en vertoont een alarmerende resistentie. Het protease A (HtrA), dat bij hoge temperaturen nodig is en een dubbele rol speelt als chaperon en protease staat centraal in de virulentie van SP. HtrA speelt een cruciale rol in de pathologie van SP en vormt een nieuw doelwit voor antibacteriële strategieën. De exacte rol van HtrA tijdens infectie blijft echter onduidelijk en vormt dus een uitdaging voor geneesmiddelenontwikkeling. Het doel van dit project is om de protease-functie van SP-HtrA tijdens infectie te ontrafelen. Naast cyclische peptiden zullen we activiteitsgebaseerde probes (ABPs) ontwikkelen voor de detectie en lokalisatie van actieve SP-HtrA proteasen als selectieve, onomkeerbare remmers. Deze 'tools' en remmers zullen een specifiek peptideskelet bevatten, op maat gemaakt voor het actief centrum van SP-HtrA d.m.v. geavanceerde technieken zoals 'positional scanning combinatiebibliotheken' en faagdisplay, waardoor selectiviteit verzekerd is en interferentie met menselijke HtrAs vermeden wordt. We zullen deze ABPs en remmers evalueren in in vitro en in vivo infectiemodellen en via proteomics inzicht bieden in de activiteit van SP-HtrA. Met dit project ontwikkelen we een nieuwe strategie met meer potentieel dan de conventionele expressieprofileringstechnologieën om de proteaseactiviteit van SP-HtrA tijdens infectie te onderzoeken.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Prothiwa Michaela
• Co-promotor: Cos Paul
• Mandaathouder: Verma Vani

Onderzoeksgroep(en)

• Medicinale chemie (UAMC)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit projectvoorstel legt de focus op het onderzoeken van co-infecties in de luchtwegen en hoe ze invloed hebben op de immuunrespons van het lichaam. Luchtweginfecties vormen wereldwijd een belangrijke oorzaak van ziekte en sterfte, en hoewel er vaak wordt aangenomen dat een enkele ziekteverwekker verantwoordelijk is voor een infectie, wijst steeds meer onderzoek op het veelvuldig voorkomen van co-infecties, waarbij meerdere pathogenen gelijktijdig aanwezig zijn. Het centrale doel van dit project is om de effecten van verschillende co-infecties—parasitair, viraal en bacterieel—op immuuncellen in de longen te onderzoeken, zowel in vitro (in een laboratoriumomgeving) als in vivo (in levende organismen). Het project zal zich richten op: - De moleculaire mechanismen achter de immuunreactie in de longen: Dit houdt in het bestuderen van hoe het immuunsysteem in de longen reageert op infecties en co-infecties, en welke factoren bijdragen aan een verhoogde gevoeligheid voor bijkomende infecties. - De interacties tussen gastheer en pathogenen: Het onderzoek zal zich richten op hoe pathogenen de lokale micro-omgeving van het longweefsel beïnvloeden en hoe dit de immuunafweer verzwakt of versterkt. - De effecten van co-infecties op vaccins en chemotherapie: Protozoaire infecties (door eencellige parasieten) kunnen mogelijk de effectiviteit van vaccins en behandelingen zoals chemotherapie veranderen. Dit project wil begrijpen hoe een primaire infectie de reactie van het lichaam op een tweede infectie of behandeling beïnvloedt. De verwachte uitkomsten van dit onderzoek kunnen leiden tot een beter inzicht in de complexiteit van respiratoire co-infecties, wat van groot belang is voor de volksgezondheid. Daarnaast kan dit onderzoek bijdragen aan de ontwikkeling van nieuwe diagnostische technieken, verbeterde behandelingen en vaccins die specifiek gericht zijn op het aanpakken van co-infecties. Dit zou niet alleen de patiëntenzorg verbeteren, maar ook de economische lasten van luchtweginfecties verlichten. Dit project zal ook dienen als een basis voor verdere wetenschappelijke ontwikkeling en de onderzoeker ondersteunen in het opbouwen van een onafhankelijk onderzoeksprofiel binnen dit relevante veld van de infectieziekten.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Caljon Guy
• Co-promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Delputte Peter
• Mandaathouder: Araujo Sergio

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Nosocomiale infecties vormen dagelijks een groot struikelblok op de intensive care afdeling. Een kleine 10% van de patiënten die langer dan twee dagen op deze afdeling verblijft, krijgt te kampen met zulke infecties, waarvan de zogenaamde 'ventilator-associated pneumonia (VAP)' de meest voorkomende is. Eén van de meest beduchte bacteriën die aan de basis kan liggen van deze biofilm gerelateerde infectie op de endotracheale tubes, is Pseudomonas aeruginosa. Dit project beoogt om een medische hulpmiddel te ontwikkelen dat in een preventieve context ingezet kan worden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Mandaathouder: Wouters Milan

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek-Vlaanderen. De algemene doelstelling van deze onderzoeksgemeenschap is om het ontstaan en de structuur van bacteriële en fungale biofilmen bij de mens beter te begrijpen zodat er op termijn doeltreffend kan tegen opgetreden worden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Niet-tuberculeuze mycobacteriën (NTM) zoals Mycobacterium avium complex (MAC) en Mycobacterium abscessus veroorzaken long aandoeningen die gelijken op tuberculose (TBC). Deze infecties komen voornamelijk voor in patiënten met een verzwakt immuunsysteem en in patiënten die lijden aan andere longziekten zoals cystic fibrosis. De incidentie en prevalentie van de longziekten veroorzaakt door NTM neemt wereldwijd toe, voornamelijk in de Verenigde Staten en Japan en in andere delen van de wereld waar TBC verminderd is. NTM ziekten zijn reeds minstens driemaal meer prevalent dan TBC. Behandeling van NTM infecties gebeurt met combinaties van enkele bestaande antibiotica. Echter, de antibiotica gebruikt bij de meest voorkomende bacteriën (MAC en M. Abscessus) zijn veel minder actief dan de huidige behandelingsschema's bij TBC. Bovendien is het meestal noodzakelijk om de behandeling minstens 12 tot 24 maanden aan te houden. Deze lange en complexe behandeling verhoogt bovendien de kans op het induceren van resistentie in NTM en multiresistente NTM werden dan ook al aangetoond. De voornaamste doelstelling van het Respiri-NTM project is het ontdekken van nieuwe geneesmiddelkandidaten die gebruikt kunnen worden in meer efficiënte en kortere combinatie behandelingen van NTM en multiresistente NTM en die minder vatbaar zijn voor resistentie ontwikkeling. Deze nieuwe moleculen zullen het energie metabolisme van NTM als doelwit hebben en zullen ontwikkeld worden vanuit recente ontdekte inhibitoren van de mycobacteriële respiratory keten.Bovendien zal een nieuwe fenotypische screening gebeuren om nieuwe doelwitten in NTM te ontdekken. Tenslotte zullen we ook gastheer factoren die essentieel zijn voor het intracellulaire overleven van NTM als doelwit nemen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Augustyns Koen
• Co-promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Maes Bert

Onderzoeksgroep(en)

• Medicinale chemie (UAMC)

Project website

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Ondanks grote vooruitgang in biomedisch onderzoek is tuberculosis (TB), veroorzaakt door Mycobacterium tuberculosis (Mtb), nog steeds de dodelijkste infectieziekte in de wereld. De opties voor de behandelingen zijn beperkt, duur en niet altijd verkrijgbaar in ontwikkelingslanden en de patiënten vertonen vele nevenwerkingen van de huidige geneesmiddelen. Er is dus een grote nood aan de ontwikkeling van nieuwe combinatietherapieën met meer efficiënte, kortere en veiligere behandelingen voor alle vormen van TB. Het doel van RESPIRI-TB is om nieuwe geneesmiddelkandidaten te bekomen die minder gevoelig zijn aan resistentie-ontwikkeling en die een kortere therapieduur geven voor TB en multi-drug TB. Zo'n geneesmiddelencombinatie zal synergistisch werken op het energiemetabolisme van Mtb of op complementaire doelwitten. Om dit te bereiken worden recent ontdekte inhibitoren van de Mtb respiratoire pathway verder ontwikkeld. Daarnaast richt het onderzoek zich op het Mtb moleculair mechanisme om reactieve zuurstofverbindingen te reduceren.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Cappoen Davie
• Co-promotor: Delputte Peter

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het onderzoek heeft tot doel een bestaand EU onderzoeksvoorstel te verbeteren over de ontwikkeling van in vitro en in vivo modellen om de opname van nucleïnezuren in levende bacteriën te kwantificeren, en zo het onderzoeksvoorstel voor te bereiden op herindiening in een volgende ronde. Dit onderzoek zal een grote bijdrage leveren aan de ontdekking van nieuwe antibacteriële middelen. Het budget zal voornamelijk gebruikt worden voor het vergaren en het interpreteren van preliminaire data aan de hand van nieuwe experimenten, met de nadruk op de ontwikkeling van bioluminescente bacteriële stammen voor in vivo onderzoek.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Luchtweginfecties bij de mens leiden tot een spectrum van symptomen van variabele ernst en tot een wereldwijde morbiditeit, mortaliteit en economische verliezen. Ademhalingspathogenen kunnen zich gemakkelijk onder de bevolking verspreiden en zijn vaak verantwoordelijk voor grootschalige uitbraken, epidemieën en zelfs pandemieën. Hoewel dergelijke pandemieën verwoestende gevolgen hebben voor de menselijke gezondheid en een grote socio-economische impact hebben, is de jaarlijkse infectielast met Respiratoir Syncytieel Virus (RSV), Mycobacterium tuberculosis en Streptococcus pneumoniae ook aanzienlijk. Luchtweginfecties zijn wereldwijd doodsoorzaak nummer één bij kinderen onder de vijf jaar met ongeveer 650.000 jaarlijkse overlijdens. De ziektelast gaat echter verder dan dit duizelingwekkende aantal, met een algemeen effect op de morbiditeit en mortaliteit in de algemene wereldbevolking (~2,5 miljoen jaarlijkse overlijdens). Van bijzonder belang is dat ernstige luchtweginfecties niet alleen afhangen van één bepaald pathogeen, maar ook van voorgaande infecties of co-infecties. Het belang en de impact van co-infecties zijn echter nog niet helemaal duidelijk. Daarom is er een dringende behoefte om onze kennis van gastheer-pathogeen interacties op de long (immune) interface te verbeteren en om klinisch relevante diermodellen te ontwikkelen. Proefdierstudies zijn een hoeksteen van fundamenteel onderzoek en van de ontwikkeling van nieuwe profylactische, diagnostische en therapeutische modaliteiten. De ontwikkeling van geschikte infectiemodellen kan echter zeer uitdagend zijn, want vaak resulteert dit in zeer nauwe testvensters omwille van de snelle klaring van het pathogeen of vroege mortaliteit van de gastheer. De onderzoeksteams die bij deze uitdaging betrokken zijn, hebben jarenlange expertise met infectiemodellen, zowel in vitro als in knaagdieren. Drie PI's op LMPH richten hun onderzoek op parasitaire (prof. Caljon), bacteriële (prof. Cos) en virale infecties (prof. Delputte) om inzicht te krijgen in beschermende aangeboren en adaptieve immuunresponsen, en in (immuun-)pathologie. Een recente studie waarbij LMPH betrokken was, toonde aan dat sommige long-bacteriën een immunomodulerende activiteit hebben bij chronische luchtwegaandoeningen (Rigauts et al., Eur. Resp. J., 2022). Zeer recente parasitologische waarnemingen tonen aan dat Afrikaanse trypanosomen snel en permanent het longweefsel koloniseren met een sterke invloed op de immunologische samenstelling van het weefsel (sterke reducties van B cellen en eosinofielen), zonder duidelijke ademhalingsstoornissen of pathologie. Verrassend genoeg resulteert dit in een verhoogde en aanhoudende RSV-replicatie, wat duidt op complexe in vivo interacties die niet in vitro gemodelleerd kunnen worden (Mabille et al., Nat. Commun., in afwachting van aanvaarding). Door gebruik te maken van de expertise in parasitaire, virale en bacteriële infecties op LMPH, de beschikbaarheid van high-end platformen voor het evalueren van longfunctie en immunologische parameters en initiatieven van biobanking, heeft deze uitdaging tot doel de functionele en immunologische impact van longinfecties en co-infecties van parasitaire, virale en bacteriële oorsprong te bestuderen. Dit zal onschatbare informatie opleveren over de virulentie en pathogeen karakter van geselecteerde stammen uit eigen collecties, het opzetten van in vivo assays en het ontrafelen van immunologische parameters die correleren met pathologie. Naast de voortschrijdende wetenschappelijke basisinzichten in interacties tussen gastheer en pathogenen, zijn de toepassingen talrijk, waaronder de ontwikkeling en evaluatie van diagnostica en medicinale verbindingen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Caljon Guy
• Co-promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Delputte Peter
• Mandaathouder: Araujo Sergio

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Bacteriële infecties spelen een belangrijke rol bij veel longziekten, waaronder infectieuze exacerbaties van chronische obstructieve longziekte (COPD) of community-acquired pneumonia (CAP), een van de meest vastgestelde ziekten wereldwijd. Om de long te infecteren produceren bacteriële pathogenen talrijke proteasen met essentiële functies voor levensvatbaarheid van cellen, fysiologie en virulentie, zoals het elastase B geproduceerd door Pseudomonas aeruginosa dat uitgebreide longschade veroorzaakt tijdens longontsteking. Deze proteasen zijn veelbelovende kandidaten als geneesmiddelendoelwit of als biomerker bij longinfectie, maar de exacte mechanismen waarmee ze bijdragen tot virulentie zijn nog niet opgehelderd. Het hier beschreven onderzoeksthema gebruikt de kracht van chemische probes om de virulente rol van bacteriële proteasen te begrijpen. De geselecteerde postdoc zal zeer potente en selectieve chemische probes ontwikkelen die ons inzichten zullen geven omtrent de activiteit van bacteriële proteasen in infectiemodellen en patiëntenstalen. Dit zal het mogelijk maken om (1) nog onbekende virulentiefuncties van bacteriële proteasen bij longziekten, zoals biofilmvorming en persistentie, bloot te leggen en (2) bacteriële proteasen te evalueren als potentiële biomerkers voor bacteriële longinfecties. De twee belangrijkste groepen chemische tools om protease-activiteit in kaart te brengen zijn Activity-Based Probes (ABPs) en substraatprobes. ABPs zijn kleine moleculen die zich covalent binden aan het actief centrum van doelwitenzymen. Zij bevatten een herkenningssequentie, een detectietag en een elektrofiele of fotoreactieve groep om zich aan het actief centrum te binden. Substraatprobes bestaan uit herkenningssequenties geflankeerd door reagentia die na splitsing een fluorescerende readout genereren. De kandidaat zal deze tools synthetiseren op basis van bekende remmers of substraten van bacteriële proteasen geproduceerd door longpathogenen, zoals Haemophilus influenzae of Streptococcus pneumoniae. Veel longpathogenen gedragen zich bijzonder virulent door te persisteren in epitheelcellen, waardoor ze de humane immuunrespons en antibiotica-behandeling kunnen ontwijken. De rol van bacteriële proteasen tijdens persistentie is echter vaak onbekend. Daarom zal de kandidaat de nieuwe probes, na biochemische validatie, toepassen in in vitro en in vivo infectiemodellen om de enzymactiviteit tijdens persistentie te monitoren (i.s.m. Prof. Paul Cos). Door hun hoge selectiviteit voor bacteriële proteasen zullen de nieuwe instrumenten bovendien perfect geschikt zijn als activiteitsgebaseerde diagnostiek. Hoewel diagnose cruciaal en hoogdringend is bij acute ademhalingsziekten, ontbreken vaak diagnostische tests die snel duidelijkheid verschaffen over de ziekteverwekker. Daarom zal de postdoc kandidaat de probes testen in stalen van gehospitaliseerde patiënten met longinfecties en ze evalueren als potentiële activiteitgebaseerde diagnostische tools (i.s.m. Prof. Thérèse Lapperre).

Onderzoeker(s)

• Promotor: Augustyns Koen
• Co-promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Lapperre Therese
• Mandaathouder: Verma Vani

Onderzoeksgroep(en)

• Medicinale chemie (UAMC)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Deze aanvraag heeft als doel de aankoop van nieuwe basisinfrastructuur, een toestel voor het sorteren en isoleren van individuele cellen met behulp van microfluidics. Het toestel is inzetbaar voor heel diverse toepassingen in cellijn ontwikkeling, monoklonale antistof ontwikkeling, iPSC kloneren, single cell omics, het isoleren van zeldzame cellen, microbiologie, virologie, immunologie en microbiële biotechnologie. Het toestel het werkt op lage druk, is gemakkelijk op te zetten en laat toe om vlot over te schakelen tussen verschillende toepassingen, zowel met als zonder infectieuze agentia.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Delputte Peter
• Co-promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Lebeer Sarah
• Co-promotor: Ogunjimi Benson
• Co-promotor: Vorsters Alex

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit onderzoeksproject richt zich op droge ogen ziekte (DED of dry eye disease), een multifactoriële aandoening van het traanvocht en het oogoppervlak die leidt tot symptomen van ongemak, visuele stoornissen en instabiliteit van de traanfilm. Het gaat gepaard met een verhoogde osmolariteit van de traanfilm en ontsteking van het oculaire oppervlak. DED kan worden onderverdeeld in traandeficiënte en evaporatieve types. Evaporatieve droge ogenziekte kan worden onderverdeeld in de Meiboomklierdysfunctie (MKD) en blootstellingsgerelateerde droge ogen. MKD is de meest voorkomende oorzaak van evaporatieve droge ogenziekte en wordt gedefinieerd als "een chronische, diffuse afwijking van de Meiboomklieren, gewoonlijk gekenmerkt door eindbuisobstructie en/of kwalitatieve/kwantitatieve veranderingen in de klierafscheiding". Onderzoek naar MKD is een prioriteit. Een geschikt diermodel is daarom een essentieel instrument om translationeel onderzoek mogelijk te maken met als einddoel het vinden van betere behandelingen voor droge ogenziekte. Dit project is een voortzetting van het MSCA-ITN IT-DED3-project. Een van de grootste uitdagingen is de evaluatie van het cytokineprofiel in een kleine hoeveelheid traanvocht van ratten. Voorlopige resultaten met een op maat gemaakte multiplex (3plex) Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) zijn veelbelovend en de assay zal verder worden geoptimaliseerd en gevalideerd. Het evaporatieve diermodel voor droge ogen zal verder worden geoptimaliseerd op basis van de eerdere resultaten. Om het aantal dierproeven tot een minimum te beperken, wordt ook gewerkt aan een celkweekmodel waarin DED wordt geïnduceerd door het gebruik van hyperosmolaire stress bij monocyten en cornea- en conjunctivale epitheelcellen. Dit zal ons toelaten om de antioxidatieve werking van de meest veelbelovende ontstekingsremmende verbindingen te testen in een in vitro model.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Mandaathouder: Compagnone Agnese

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Streptococcus pneumoniae is een belangrijke humane pathogeen. Het is één van de meest voorkomende oorzaken van long- en middenoorontstekingen. Het bestrijden van deze infecties is moeilijk. Het fenomeen van serotype-switching bemoeilijkt het gebruik van vaccins. Ook antibiotica resistentie is een opkomend probleem. Verder wordt persistentie gezien als een belangrijk, maar onderbelicht fenomeen. Persisters worden gedefinieerd als een subpopulatie van cellen, tolerant aan lethale antibioticaconcentraties, en zijn betrokken bij verschillende chronische en recurrente infecties. Toch is er nog niets geweten over het fenomeen van persistervorming bij S. pneumoniae. Met dit project willen we dit hiaat opvullen. Het proces van autolyse bemoeilijkt langdurige studies met in vitro culturen. Om dit te vermijden zal een waaier aan strategieën, waaronder het maken van mutante stammen, worden ontwikkeld. Met overervingsexperimenten en gen sequeneringen om resistentie-mutaties uit te sluiten, zal de aanwezigheid van persisters worden bevestigd. Vervolgens zal er een in vivo model geoptimaliseerd worden dat kan gebruikt worden om de klinische relevantie van de in vitro resultaten te bevestigen. Tenslotte zal de correlatie tussen persistervorming, het antimicrobieel profiel, de oorsprong van de stam en de in vivo virulentie van 50 klinische isolaten worden geëvalueerd. Dit project zal de inzichten in het belang van persisters in de pathologie van S. pneumoniae infecties sterk verbeteren.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Mandaathouder: Geerts Nele

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Persisterende longinfecties gaan meestal samen met de vorming van biofilms, wat kenmerkend is voor chronische ziekten zoals mucoviscidose (cystic fibrosis of CF). Bovendien is biofilmvorming in endotracheale tubes (ETT) gerelateerd aan ventilator-geassocieerde longontsteking (Ventilator-Associated Pneumonia of VAP) en dit geeft aanleiding tot een hoge morbiditeit en mortaliteit. Naast antibioticaresistentie kan het falen van antibioticatherapie ook het gevolg zijn van de hergroei van een kleine populatie van bacteriën die persisters worden genoemd. Wanneer bacteriën worden behandeld met een dodelijke dosis antibiotica, overleeft deze kleine fractie van antibiotica-tolerante cellen om daarna een nieuwe populatie te genereren, welke dan zorgen voor de chronische aard van de longontsteking. Daarom zijn nieuwe ideeën nodig om biofilm-gerelateerde longinfecties te voorkomen en te behandelen. Nieuwe antibacteriële doelwitten en incorporatie van antibacteriële verbindingen in 3D-geprinte katheters worden momenteel onderzocht. Een chronisch P. aeruginosa longinfectiemodel, op basis van intratracheale infectie van bacteriën ingekapseld in alginaat beads, werd geoptimaliseerd in samenwerking met de KULeuven om persistentie te karakteriseren. Dit diermodel bootst CF na en verschillende laboratoriumstammen met lage en hoge persistentie worden momenteel in vivo onderzocht om de infectiedosis en het behandelingsschema voor persistentiestudies te valideren. Natuurlijke isolaten uit andere klinische omgevingen, zoals dierlijke en natuurlijk oorsprong, zullen ook worden getest. Het VAP-model kadert in een H2020 ETN-project, genaamd PRINT-AID. Het doel van dit project is om een nieuwe generatie van 3D-geprinte, gepersonaliseerde medische hulpmiddelen met antimicrobiële functie te ontwikkelen en te evalueren. Evaluatie van nieuwe lead compounds, in vitro testen in dynamische biofilmsystemen en celmodellen, en verbetering van het productieproces van 3D-geprinte en gecoate katheters worden momenteel uitgevoerd. UAntwerpen zal verantwoordelijk zijn voor de ontwikkeling van een VAP-muismodel waarin de 3D-geproduceerde katheters, die eerst geïnoculeerd zullen worden met biofilm-vormende S. aureus, intratracheaal in de hoofdbronchus worden ingebracht. Met dit diermodel willen we zowel de remming van bacteriële adhesie aan tubes in vivo als hun in vivo antibacteriële werking bestuderen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het hoofddoel van het SPRINGBOARD-project is het onderzoekspotentieel van het Letse Instituut voor Organische Synthese (LIOS) te versterken door het opzetten van een samenwerkingsnetwerk met de toonaangevende Europese onderzoeksinstellingen Universiteit Antwerpen, Universiteit Kopenhagen, Universiteit Florence en Universiteit Helsinki - in het domein van geavanceerde ontwikkeling van nieuwe antibacteriële geneesmiddelen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Augustyns Koen

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Additive manufacturing (AM) -technologieën zijn op grote schaal gebruikt in vele wetenschapsdomeinen en toepassingen. Gepersonaliseerde geneeskunde is een van de meest veelbelovende domeinen die kan profiteren van dergelijke technologieën. De Food and Drug Administration (FDA) keurde in 2016 het eerste met geneesmiddel-geïncorporeerd medisch hulpmiddel goed dat via AM geproduceerd werd door de firma Aprecia Pharmaceuticals. Fused filament fabrication (FFF) is een van de AM-technologieën die afhankelijk is van de extrusie van een gesmolten polymeer door een nozzle. De opeenvolgende beweging in de driedimensionale ruimte tijdens het extruderen van het materiaal resulteert in het produceren van objecten met een hoge geometrische complexiteit. Dergelijke geproduceerde objecten konden niet worden gebouwd met conventionele productietechnologieën. Deze technologie heeft met name een groot potentieel in de farmaceutische sector, omdat deze berust op een gekende technologie die wordt gebruikt voor het produceren van hulpmiddelen met geïncorporeerde geneesmiddelen, namelijk hotmelt extrusie (HME) genaamd. In deze technologie wordt een dragerpolymeer gemengd met een bekend actief farmaceutisch ingrediënt (API) met behulp van een schroefextrusiesysteem en vervolgens warm geëxtrudeerd door een matrijs voor verdere verwerking. Dit project is een verderzetting van het PrintAID ITN-project. Het doel is om 3D-printing technologieën te gebruiken voor het printen van anti-infectieuze medische hulpmiddelen. Deze hulpmiddelen dienen biofilm-gerelateerde infecties te voorkomen. Geselecteerde antibacteriële agentia zullen geanalyseerd worden voor hun mechanische, rheologische en thermische eigenschappen en de beste zullen geselecteerd worden als carrier voor de antibacteriële agentia. FFF 3D printing technologie zal aangepast en dan gebruikt worden voor het produceren van medische hulpmiddelen met de geselecteerde formulatie. De aanpassingen zullen zich richten op de reconfiguratie van het extrusiesysteem om het om te zetten van een conventionele filament extruder naar een pellet extruder, zodat een uitgebreidere materiaalselectie mogelijk is. Deze hulpmiddelen zullen getest worden op hun mechanische integriteit en formulatie stabiliteit. In vitro en in vivo stalen zullen geproduceerd worden voor het bestuderen van hun profiel met betrekking tot vrijstelling en activiteit van het antibacterieel agens. Het ultieme doel is een proof-of-concept hulpmiddel te produceren dat bacteriële infecties op bv. Endotracheale tubes kan voorkomen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het project getiteld "The Exploration of novel rapid technologies and alternatives to conventional microbiological test approaches" exploreert nieuwe methoden om de klassieke microbiologische testen te vervangen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Deze aanvraag heeft betrekking op de aankoop van nieuwe basisinfrastructuur, meer specifiek een FlexiVent-systeem van Emka Technologies. FlexiVent is een platform voor standaard respiratoir onderzoek dat kan worden gebruikt in vele toepassingen van pulmonaire onderzoek. Het systeem biedt grote voordelen in vergelijking met de klassieke, niet-invasieve plethysmografie omdat het nauwkeurig, reproduceerbaar en een bewezen nut heeft op basis van de vele publicaties. FlexiVent is veel beter in staat longafwijkingen op te sporen via veranderingen in functionele residuele capaciteit, totale longcapaciteit, vitale capaciteit en compliantie van de luchtwegen. Bovendien laat analyse van longfuncties via FlexiVent toe luchtwegaandoeningen bij muizen te onderscheiden door gebruik te maken van klinisch relevante variabelen en wordt daarom algemeen geaccepteerd als de gouden standaard in de functionele evaluatie van infectieuze en niet-infectieuze pathologische, respiratoire ziektemodellen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Delputte Peter
• Co-promotor: Verhulst Stijn

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Progressief pulmonaire infecties door species van het Mycobacterium avium–intracellulare complex (MAC) zijn meer en meer prevalent in geïndustrialiseerde landen. Ze zijn behandelbaar, maar een doorsnee regime duurt 12 maanden en omvat combinaties van meerdere antibiotica. Een kernprobleem dat de ontwikkeling van nieuwe of meer efficiënte behandelingen in de weg staat, is het ontbreken van een snelle diagnostische test voor druggevoeligheid in MAC. De huidige methoden zijn extreem traag (3-5 weken), slecht reproduceerbaar en moeilijk te interpreteren. In dit project ontwikkelen we een nieuwe gevoeligsheidstest voor MAC. Ons kernidee is dat een gevoelige bacterie stress voelt in aanwezigheid van een antibioticum, en een resistente niet. De test is dan ook gebaseerd op multiplex metingen van relatieve hoeveelheden van drug-specifieke mRNA merkers na contact met een antibioticum. Dit concept is totaal vernieuwend. Het onderzoek start met transcriptie analysen van MAC onder druk van antibiotica. We zullen probes ontwikkelen om meest uitgesproken stressgenen in multiplex te kwantificeren via Luminex. De parameters van de RNA-gebaseerde drugtest worden geoptimaliseerd met een klinisch relevante set van MAC isolaten. Tenslotte zullen we dit platform gebruiken om synergetische interacties op te sporen tussen oude en nieuwe anti-MAC antibiotica. Het einddoel is een optimale combinatie van antibiotica te identificeren, met de grootst mogelijke impact op klinische MAC isolaten.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Cappoen Davie
• Mandaathouder: Sury Amandine

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Longziekte veroorzaakt door leden van het Mycobacterium avium complex (MAC) neemt wereldwijd toe. Behandeling van MAClongziekte vereist een combinatie van meerdere geneesmiddelen die tot 12 maanden duurt en die vaak leidt tot bijwerkingen, falen van de behandeling, herinfectie van MAC en de opkomst van geneesmiddelresistentie. Hierdoor moeten nieuwe strategieën onderzocht worden die kunnen leiden tot een meer succesvolle behandeling van MAC-infecties. Mycothiol cysteïne ligase (MshC) en het mycothione reductase (Mtr) zijn twee belangrijke enzymen van de bacillaire redox-homeostase en zijn nog niet geëxploreerde targets. Onze hypothese is dat deze genen een essentiële rol spelen in zowel de virulentie als de stresstolerantie binnen MAC en dat deze genen targeten tot een synergistisch effect zou kunnen leiden met bestaande en opkomende anti-mycobacteriële therapeutica. In dit projectvoorstel proberen we deze hypothesen te onderzoeken door een panel van recombinante MAC-stammen te genereren die ons toelaten om de impact van de doelwitgenen op de fysiologische groei, stresstolerantie, cellulaire en in vivo virulentie en synergie met bestaande of opkomende MAC therapeutica te bestuderen. De bevindingen kunnen toekomstige doelgerichte geneesmiddelenontwikkelingsprogramma's van potentiële Mtr- en MshC-inhibitoren ondersteunen. Op lange termijn kunnen de bevindingen in dit onderzoek leiden tot een veiligere, kortere en meer kosteneffectieve behandeling van MAC-infecties.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Cappoen Davie
• Mandaathouder: Piller Tatiana

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Mycobacterium tuberculosis (Mtb) veroorzaakt tuberculosis dat een belangrijk wereldwijd gezondheidsprobleem is. TB is verantwoordelijk voor meer dan 1.7 miljoen doden in 2016. De prevalentie van geneesmiddelenresistentie bij Mtb vraagt om nieuwe en specifieke doelwitten die zich richten op unieke pathways. Het project richt zich op een multidisciplinaire aanpak om de redox homeostasis bij Mtb te verstoren.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Cappoen Davie
• Co-promotor: De Winter Hans

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

In dit project worden de anti-inflammatoire effecten van Rothia mucilaginosa getest in complexe en fysiologisch relevante in vitro modellen van cystic fibrosis en COPD lung inflammatie en in muizenmodellen. De anti-inflammatoire stoffen geproduceerd door deze bacterie worden geïdentificeerd en hun werkingsmechanisme bepaald.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds VLIR. UA levert aan VLIR de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project zal voor de larven van de zwarte soldatenvlieg (BSFL) nieuwe toepassingen onderzoeken met een hogere meerwaarde dan hun waarde nu als voederingrediënt. Preliminair onderzoek bevat aanwijzingen rond extra valorisatiemogelijkheden voor deze larven in de veevoeder-, farma- en afvalverwerkingssector, die een hogere meerwaarde genereren. Dit project wil dan ook de "zwarte" in "gouden larven" veranderen. Zo willen we strategieën ontwikkelen die gebruik maken van (symbiotische) micro-organismen om (i) de productiviteit van de larven te verhogen, (ii) de microbiële veiligheid te verhogen, (iii) de nutritionele samenstelling te verbeteren, (iv) nieuwe antimicrobiële stoffen te identificeren en (v) de afbraak van plastics en hun additieven mogelijk maken en/of versnellen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UAntwerpen en anderzijds de opdrachtgever. UAntwerpen levert aan de opdrachtgever de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het Europees netwerk voor de geïntegreerde training in geneesmiddelenontwikkeling voor de ziekte van droge ogen (IT-DED3) heeft als doel om multidisciplinaire en ondernemende onderzoekers op te leiden in de ontwikkeling van nieuwe therapieën voor patiënten die leiden aan droge ogen ziekten (DED). DED is een chronische, mulltifactoriële aandoening van het oogoppervlak en is een groot en toenemend gezondheidsprobleem. Ontwikkeling van nieuwe geneesmiddelen en translatie van "bench to bedside" is hoogstnodig en daarom verenigt IT-DED3 expertise in medicinale chemie, proceschemie, oogformulatie, DED ziektemodellen, beeldvorming, biomerker onderzoek en klinische oftalmologie.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Augustyns Koen
• Co-promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Medicinale chemie (UAMC)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Leishmaniasis is een belangrijke parasitaire aandoening met verscheidene klinische manifestaties, inclusief de dodelijke viscerale vorm. Nieuwe initiatieven rond medicijnontwikkeling zijn van essentieel belang gezien de ernstige bijwerkingen van de huidige behandelingen en/of de toenemende ontwikkeling van geneesmiddelresistentie. Dit project beoogt nieuwe concepten te ontwikkelen om problemen van behandelingsfalen te omzeilen. Door de introductie van een zandvlieg-kolonie op LMPH, zullen de gastheer-parasiet interacties zoals parasiet virulentie, immuniteit en ziekte-geassocieerde pathologie, en de effectiviteit van de behandeling bestudeerd kunnen worden in proefdiermodellen waarin de infectie geïnitieerd wordt door een beet van de insect vector. Deze natuurlijke infecties zullen ook een verbeterde karakterisering van nieuwe anti-leishmania producten, controle van de effectiviteit van de behandeling en de ontwikkeling van geneesmiddelen-resistentie en de aanpassing van klinische isolaten aan in vitro en in vivo laboratorium modellen toelaten. Deze studie zal tevens de interactie bestuderen tussen gastheer immuuncellen (neutrofielen en monocyten) en recente klinische parasiet-isolaten en laboratoriumstammen met verschillen in virulentie geassocieerd met resistentie tegen geneesmiddelen. Cellulaire reacties zullen hierbij worden bestudeerd met behulp van een state-of-the-art kinomics platform, waarmee fenotypische vingerafdrukken van intracellulaire kinase activering op een eenvoudige manier afgenomen kunnen worden. Dit zal belangrijke informatie opleveren over de parasiet-gastheer interactie en over ontstekingsreacties in het algemeen. Gezien neutrofielen infectie-bevorderende eigenschappen werden toegeschreven, zal selectieve beïnvloeding van hun immune cel functies worden onderzocht als een aanvullende strategie om parasitaire infecties te controleren. Dit is een nieuwe aanpak die minder onderhevig zou moeten zijn aan de ontwikkeling van resistentie-mechanismen. Deze strategie zou ook ondersteunend kunnen zijn tot de identificatie van nieuwe medicijn- en vaccinatie-targets

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Caljon Guy
• Co-promotor: Maes Louis

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Behandeling van tuberculosis wordt bemoeilijkt door de aanpassingen van de pathogeen Mycobacterium tuberculosis die toelaten om te overleven en te groeien in de gastheer macrofaag. Een beter inzicht in de gastheer-pathogeen interactie en ook de ontwikkeling van nieuwe behandelingsmogelijkheden zijn dus essentieel. Een veelbelovende strategie is de receptor-gemediëerde afgifte van therapeutica via de endocytische Sialoadhesine receptor aanwezig op het oppervlak van fagocyten.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Caljon Guy
• Co-promotor: Delputte Peter
• Mandaathouder: Cappoen Davie

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds de opdrachtgever. UA levert aan de opdrachtgever de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds de opdrachtgever. UA levert aan de opdrachtgever de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds VLIR. UA levert aan VLIR de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract. Het doel van het project is om een center of excellence te installeren in Centraal-Oost Cuba voor onderzoek naar traditioneel gebruikte bioactieve planten en hun metabolieten.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: De Winter Hans
• Co-promotor: Pieters Luc

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het doel van dit ETN project is om een nieuw Europees onderwijsplatform uit te bouwen die jonge onderzoekers zullen opleiden om innovatieve oplossingen uit te werken tegen biofilm-gerelateerde infecties door de ontwikkeling van anti-infectieuze 3D-geprinte medical devices. Grensverleggende printing technologieën zullen gecombineerd worden met in vitro en in vivo biofilm modellen en nieuwe tools voor data integratie en standaardisatie. Doctoraatsopleidingen zullen plaatsvinden in een netwerk van 12 partners, waaronder 5 industriële partners, van de EU en de VS.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Antibiotica zijn essentieel in de medische praktijk om een antwoord te bieden aan levensbedreigende infectieziekten. De evolutie van antibiotica resistentie is momenteel een grote bedreiging voor de gezondheidszorg met verhoogde morbiditeit en mortaliteit tot gevolg. Daarnaast kan antibiotica therapiefalen ook leiden tot een subpopulatie van antibiotica-tolerante persister bacteriën. In dit project worden in vitro en in vivo experimenten uitgevoerd om dit verder te onderzoeken voor urinaire tractus en longinfecties.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Voor een groep van symmetrisch gesubstitueerde 1,3-diaryl triazenes werd een sterke antimycobacteriële activiteit aangetoond. In vitro werden geen indicaties voor genotoxiciteit en mutageniciteit vastgesteld en bovendien bleek de antimycobacteriële activiteit, de cytotoxiciteit en de daaruit vloeiende selectiviteitsindex sterk afhankelijk van het substitutie-patroon. In dit project wordt onderzocht (i) hoe de huidige lead verder kan worden geoptimaliseerd, (ii) in welke mate deze moleculen voldoen aan de criteria van het WHO, en (iii) hoe het werkingsmechanisme van deze 1,3-diaryl triazenes functioneert zodat deze makkelijker kunnen worden opgenomen in combinatie-therapieën.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Cappoen Davie
• Mandaathouder: Torfs Eveline

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit DnDi gefinancierd project behelst de preklinische evaluatie van anti-parasitaire compounds voor de behandeling van Leishmaniasis, de ziekte van Chagas en Afrikaanse trypanosomiase. Compounds worden ook geëvalueerd op hun cytotoxiciteit.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Caljon Guy
• Co-promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Maes Louis

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht toegekend door de Universiteit Antwerpen. De promotor levert de Universiteit Antwerpen de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd door de universiteit.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Augustyns Koen
• Co-promotor: Apers Sandra
• Co-promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Delputte Peter
• Co-promotor: De Meester Ingrid
• Co-promotor: De Winter Hans
• Co-promotor: D'Haese Patrick
• Co-promotor: Hermans Nina
• Co-promotor: Kiekens Filip
• Co-promotor: Lambeir Anne-Marie
• Co-promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Pieters Luc
• Co-promotor: Van Der Veken Pieter
• Mandaathouder: Joossens Jurgen
• Mandaathouder: Pauwels Maxim
• Mandaathouder: Verhoeven Kristien

Onderzoeksgroep(en)

• Medicinale chemie (UAMC)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek-Vlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Abbaspour Tehrani Kourosch
• Mandaathouder: Cappoen Davie

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit doctoraat wil de oorzaken bestuderen van het falen van miltefosine in de behandeling van viscerale leishmaniasis. Bioluminescente Leishmania infantum en L. donovani stammen en in vivo imaging laten toe om op een niet-invasieve manier de parasitaire lading en distributie op te volgen tijdens MIL-behandelingen met verschillende doses en duurtijd. Ook het belang van in vivo parasitaire niches, latente infecties en parasitaire MIL-resistentie in therapiefalen zullen bestudeerd worden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Caljon Guy
• Promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Maes Louis
• Mandaathouder: Eberhardt Eline

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit onderzoek focuseert zich op de rol van endotheliaal NO synthase (eNOS) bij ischemie-en reperfusieschade in de long. Tijdens de ischemieperiode ondergaat het eiwit eNOS een conformatieverandering waarbij vrije radicalen gegenereerd worden. Tijdens de hierop volgende reperfusiefase reageren de nieuw aangevoerde zuurstofmoleculen met deze radicalen, wat tot een kettingreactie leidt en uiteindelijk tot schade aan de longarchitectuur. Het doel van dit onderzoek is eerst dierexperimenteel, en later klinisch, aan te tonen dat deze ontkoppeling effectief plaatsvindt tijdens IR-schade van de long.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Schil Paul
• Co-promotor: Cos Paul
• Mandaathouder: Gielis Jan

Onderzoeksgroep(en)

• Antwerps chirurgisch training, anatomie en onderzoekscentrum (ASTARC)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Ondanks goede prestaties van solid state fermentatie (SSF) op laboschaal, bezit het proces op industriële schaal een aantal nadelen zoals slechte warmteoverdracht en moeilijke pH-regeling. Knelpunt is het gebrek aan informatie over de microbiële kinetiek in SSF als gevolg van de heterogene aard en complexiteit. Dit project beoogt het modelleren van groeikinetiek van Monascus op rijst op basis van experimenten in een computergestuurde SSF-reactor.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cornet Iris
• Co-promotor: Apers Sandra
• Co-promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Biochemische Afvalwater Valorisatie & Zuivering (BioWaVE)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds Capes (Brazilië). UA levert aan Capes de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Maes Louis

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Aandoeningen aan het oppervlak van het oog, zoals droge ogen, vertonen een prevalentie tussen 15 en 29%. De enige FDA goedgekeurde behandeling op voorschrift is cyclosporine 0.05% (Restasis®), maar deze formulatie is niet beschikbaar in de EU. Nieuwe therapieën voor ziekte aan het oogoppervlak zijn dus noodzakelijk. De expertise aanwezig in ADDN creëert een unieke opportuniteit om hierrond een onderzoeksplatform op te zetten met als doel een verhoogde samenwerking met bedrijven.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Augustyns Koen
• Co-promotor: De Meester Ingrid
• Co-promotor: Joossens Jurgen
• Co-promotor: Kiekens Filip
• Co-promotor: Lambeir Anne-Marie
• Co-promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Van Der Veken Pieter

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds VLIR. UA levert aan VLIR de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De doelstelling van dit project is om nieuwe mechanismen te identificeren voor modulatie van macrofagen tijdens activatie van het immuunsysteem en tijdens infectie met pathogenen met behulp van sialoadhesine.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Delputte Peter
• Co-promotor: Cos Paul
• Mandaathouder: De Schryver Marjorie

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Viscerale leishmaniasis (VL) wordt veroorzaakt door Leishmania donovani en Leishmania infantum. De huidige therapieën worden geassocieerd met resistentie, hoge kostprijs, parenterale toediening of ernstige nevenwerkingen. Miltefosine (MIL) is hierbij het eerste orale geneesmiddel tegen VL met een goed therapeutisch effect en gebruiksgemak en een aanvaardbaar veiligheidsprofiel. Het werd recent gepositioneerd als eerstelijnstherapie in India, Nepal en Bangladesh. Miltefosine heeft heel wat karakteristieken die resistentie-ontwikkeling bevorderen. De selectie van MIL-resistente stammen moet voorkomen en opgevolgd worden, voornamelijk omdat er geen alternatieve geneesmiddelen in klinische ontwikkeling zijn. Om de ontwikkeling van MIL-resistentie proactief aan te pakken, is laboratoriumonderzoek naar de resistentiemechanismen en hun celbiologische en klinische gevolgen erg belangrijk. Dit onderzoeksproject heeft als doel een gestandaardiseerd, klinisch relevant laboratoriummodel voor MIL-resistentie-inductie te ontwikkelen. De MIL-resistente stammen zullen gebruikt worden om het effect van resistentie op MIL-opname en parasiet-cel interactie te bestuderen in Leishmania-geïnfecteerde macrofagen. Waarbij ook de parasitaire fitheid van de resistente stammen wordt onderzocht.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Cos Paul
• Mandaathouder: Mondelaers Annelies

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het hoofddoel van dit project is een nieuw therapeutisch concept te lanceren door nieuwe actoren betrokken bij de weerstandigheid tegen antimicrobiële producten te identificeren. De inhibitie van deze nieuwe doelwitten door "antimicrobial potentiators" zal aanleiding geven tot een verhoogde gevoeligheid van de micro-organismen voor klassieke antimicrobiële producten.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit onderzoek focuseert zich op de rol van endotheliaal NO synthase (eNOS) bij ischemie-en reperfusieschade in de long. Tijdens de ischemieperiode ondergaat het eiwit eNOS een conformatieverandering waarbij vrije radicalen gegenereerd worden. Tijdens de hierop volgende reperfusiefase reageren de nieuw aangevoerde zuurstofmoleculen met deze radicalen, wat tot een kettingreactie leidt en uiteindelijk tot schade aan de longarchitectuur. Het doel van dit onderzoek is eerst dierexperimenteel, en later klinisch, aan te tonen dat deze ontkoppeling effectief plaatsvindt tijdens IR-schade van de long.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Schil Paul
• Co-promotor: Cos Paul
• Mandaathouder: Gielis Jan

Onderzoeksgroep(en)

• Antwerps chirurgisch training, anatomie en onderzoekscentrum (ASTARC)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek-Vlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Goossens Herman
• Co-promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Malhotra Surbhi
• Mandaathouder: Kerstens Monique

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds EU. UA levert aan EU de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Cruchten Steven
• Co-promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Comparatieve Perinatale Ontwikkeling (CoPeD)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek-Vlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek-Vlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Van Assche Tim

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds DNDI. UA levert aan DNDI de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Delputte Peter

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek-Vlaanderen. De algemene doelstelling van deze onderzoeksgemeenschap is om het ontstaan en de structuur van bacteriële en fungale biofilmen bij de mens beter te begrijpen zodat er op termijn doeltreffend kan tegen opgetreden worden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Isolaten van bacteriën zullen verzameld worden op de intensieve zorgafdeling bij patiënten met urinaire en intravasculaire catheters en endotracheale tubes voor onderzoek naar hun biofilm-vormende eigenschappen in relatie met therapiefalen. Hiervoor zal gebruik worden gemaakt van moleculair-biologische en beeldvormings technieken en in vitro en in vivo biofilm modellen. Bijzondere aandacht zal besteed worden aan Escherichia coli verantwoordelijk voor urineweginfecties, Pseudomonas aeruginosa als oorzaak van ventilatie-geassocieerde pneumonie en Staphylococcus aureus voor systemische infecties door veneuze catheters. De verkregen bank van volledig getypeerde stammen zal een diepgaande studie toelaten over mogelijke virulentie factoren die aan de basis liggen van biofilm vorming en therapiefalen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Dewilde Sylvia
• Co-promotor: Goossens Herman
• Co-promotor: Malhotra Surbhi

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Door toenemende antibioticaresistentie is er nood aan nieuwe therapieën. Een alternatieve strategie voor de behandeling en preventie van bacteriële infecties is de inhibitie van virulentiefactoren. Porphyromonas gingivalis wordt in dit project als modelorganisme gebruikt omdat het goed gekarakteriseerde proteasen, waaronder dipeptidyl peptidasen (DPP's), bezit die als virulentiefactor optreden. Het project heeft als doel te onderzoeken of een reeks nieuw gesynthetiseerde DPP-inhibitoren de pathogeniciteit van P. gingivalis kan verminderen. De activiteit van de remmers zal in vitro onderzocht worden in drie belangrijke biologische modellen die verband houden met DPP-activiteit: bacteriële groei, biofilmvorming en collageenafbraak. Tot slot zal het effect van de protease-remmers geëvalueerd worden in een P. gingivalis muismodel.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Mandaathouder: Clais Sofie

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds Dafra. UA levert aan Dafra de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project betreft fundamenteel kennisgrensverleggend onderzoek gefinancierd door het Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek-Vlaanderen. Het project werd betoelaagd na selectie door het bevoegde FWO-expertpanel.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Goossens Herman
• Co-promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Malhotra Surbhi
• Mandaathouder: Kerstens Monique

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Bepaling van de geneesmiddel-gevoeligheid van Leishmania stammen afkomstig van patiënten met HIV co-infectie, gebruik makend van een combinatie van biologische in vitro gevoeligheidstesten (LMPH) en moleculair biologische methoden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het project beoogt fundamenteel onderzoek op Giardia met betrekking tot: 1/ de mucosale interacties tussen parasiet en gastheer aan de hand van in vitro en in vivo modellen en 2/ de intestinale pathogenetische factoren (virulentie, inflammatie, motiliteit, e.a. ) die het klinische verloop van de infectie beïnvloeden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Cos Paul
• Mandaathouder: Bénéré Ely

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project stelt als doel meer inzicht te verwerven in de rol en toepasbaarheid van virulentie inhibitoren bij bacteriële infecties. De volgende objectieven worden vooropgesteld: 1. Ontwikkeling van een in vitro multi-species biofilmmodel (tandplak) met P.gingivalis. 2. Ontwikkeling van in vitro virulentiemodel voor P.gingivalis-gemedieerde collageenafbraak. 3. Ontwikkeling van P.gingivalis proefdiermodel. 4. Evaluatie van virulentie inhibitoren in bacteriële in vitro en in vivo modellen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Dit project stelt als doel meer inzicht te verwerven in de rol en toepasbaarheid van protease (DPP4) inhibitoren bij bacteriële infecties. De proof-of-concept wordt uitgewerkt aan de hand van Porphyromonas gingivalis modellen, waarbij volgende specifieke objectieven en werkpakketten worden vooropgesteld: 1. Ontwikkeling van in vitro en in vivo virulentiemodellen voor P. gingivalis. 2. Evaluatie van enzym remmers met gezuiverd recombinant P. gingivalis DPP4. 3. Evaluatie van DPP/protease remmers in bacteriële in vitro en in vivo modellen. 4. SAR en optimalisatie van de gevonden "lead compounds". 5. Biochemische karakterisatie van "lead compound" - doelwit enzym interacties.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Augustyns Koen
• Co-promotor: Lambeir Anne-Marie
• Co-promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Van Der Veken Pieter

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De specifieke objectieven van dit onderzoeksprojec zijn: ¿ Optimalisatie en validatie van de EPR methode voor ex vivo kwantificatie en identificatie van vrije radicalen in macrofagen. ¿ Bepaling van de rol van oxidatieve stress in de overlevingskansen van de Leishmania parasiet in de macrofaag. ¿ De rol van oxidatieve stress bij het werkingsmechanisme van bestaande (antimonialen) en nieuwe (PX-6518) antileishmania verbindingen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Maes Louis
• Mandaathouder: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De doelstelling van dit project is het bekomen van een reeks goed gekarakteriseerde fracties, aangerijkt met MVGM-glycoproteïnen, die potentieel kunnen gebruikt worden tegen H. pylori omwille van hun anti-adhesie en/of antimicrobiële effecten. Hierbij aansluitend zullen deze fracties eveneens gekarakteriseerd worden met betrekking tot hun resistentie tegen gastro-intestinale vertering en, in het geval van een lage verteerbaarheid, met betrekking tot mogelijke effecten op de samenstelling en bioactiviteit van de microbiota in de dikke darm.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het VLIR project omvat veldwerk binnen de context van de lopende evaluatie van de antileishmania stof PX-6518 tegen cutane Leishmania species. De belangrijkste objectieven omvatten het verkrijgen van meer inzicht en ervaring in Nieuwe-Wereld leishmaniases en een overdracht van gevalideerde in vitro laboratoriumtesten te realieren tussen de Noord- en Zuid-partners. De werking van PX-6518 tegen recent verkregen Peruviaanse veldisolaten zal verder onderacoht worden binnen de samenwerking tussen UA-LMPH en de Universiteit van Lima.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het nieuw onderzoeksinitiatief bestudeert de micro-aerofiele intestinale protozoa Giardia intestinalis. Dit organisme heeft anti-oxidatieve verdedigingsmechanismen ontwikkeld om de aanwezige O2-spanning in weefsels en organen te weerstaan, o.a. via oxidatie van cellulaire thiols, superoxide dismutase en mogelijks nog andere mechanismen. Het belang van deze mechanismen wordt ondermeer geillustreerd door het feit dat de huidige geneesmiddelen (nitro-verbindingen) door selectieve verhoging van oxidative stress hun werking hebben. Het onderzoekplan omvat volgende stappen: 1. ontwikkelen/optimalisatie van een in vitro kweekmethode voor trophozoiten. 2. vastleggen van in vitro proefomstandigheden voor inductie van cysten 3. op punt stellen van een geschikt diermodel op laboratorium knaagdieren 4. evaluatie van oxidatieve stress op overleving in vitro en in vivo door in situ kwantificering van oxidatieve/antioxidatieve en inflammatoire processen 5. onderzoek naar nieuwe actieve molecules in de in vitro en in vivo testmodellen. 6. evaluatie van bestaande disinfectantia voor de inactivering van cysten in drinkwater 7. interactie van de parasiet op intestinaal weefsel (pathologie, inflammatie, e.a..)

Onderzoeker(s)

• Promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Adriaensen Dirk
• Co-promotor: Cos Paul
• Mandaathouder: Bénéré Ely

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Voor de meeste infectieziekten is de nood voor geneesmiddelen nog steeds hoog, enerzijds omdat geen vaccins ter beschikking zijn en anderzijds omdat resistentie belangrijker wordt, wat de nood aan nieuwe geneesmiddelen steeds scherper stelt. LMPH heeft een actief programma voor de identificatie van nieuwe synthetische of natuurproducten tegen de tropische protozoaire ziekten leishmaniasis, slaapziekte, Chagas ziekte en malaria. Gevalideerde in vitro en in vivo testmodellen werden hiervoor op punt gesteld. Het consortium "Drugs for Neglected Diseases Initiative (DNDi)" heeft toegang tot bibliotheken van stoffen welke nog nooit werden getest op de vermelde ziekten. In dit project hebben beide partners hun expertise en know-how samengebracht om een beter en meer productief 'drug discovery" platform te realiseren.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Cos Paul
• Co-promotor: Delputte Peter

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Biofilms worden gedefinieerd als een gestructureerde populatie bacteriën, ingebed in een zelfgeproduceerde polymere matrix en vastgehecht aan een inert of levend oppervlak. Omdat biofilms een zeer hoge resistentie bezitten tegen biociden wordt een methode voor de detectie van Staphylococcus aureus biofilms ontwikkeld. Daarnaast worden verschillende bestaande en nieuwe biociden getest op hun capaciteit om biofilmgroei te inhiberen of bestaande biofilms te doden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De Universiteit Antwerpen (UA), het Instituut voor Tropische Geneeskunde Antwerpen (ITMA) en een farmaceutische industrie partner Tibotec hebben tot een samenwerking besloten voor het identificeren van nieuwe `lead' verbindingen tegen tropische en verwaarloosde ziekten, zoals malaria, leishmaniasis, slaapziekte en Chagas ziekte. Hierbij zal een in vitro test batterij voor middelgrote doorvoer worden op punt gesteld vanuit de gezamelijke technische know-how en die aan de huidige screeningsnoden van WHO-TDR tegemoet komt. Teststoffen (chemische en natuurlijke) zullen verkregen worden vanuit de bestaande netwerken waarbij tevens een aangepaste logistiek zal worden geimplementeerd. Een secundair objectief is de evaluatie van 'geneesmiddel ontwikkelbaarheid' door een vroege farmacologische en pre-klinische profilering van geselecteerde `hits'. Het project beperkt zich specifiek tot deze tropische ziekten die binnen de prioriteit van WHO-TDR liggen en levert realistische mogelijkheden om nieuwe 'drug leads' te identificeren.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Maes Louis
• Co-promotor: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

• Laboratorium voor Microbiologie, Parasitologie en Hygiëne (LMPH)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

In het onderzoek zullen antivirale en anti-oxidatieve verbindingen geïsoleerd worden uit medicinale planten voor de ontwikkeling van een complementaire therapeutische strategie tegen HSV- en HIV-infecties.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Vlietinck Arnold
• Mandaathouder: Cos Paul

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject