Charlotte Adams
In het eerste jaar van haar doctoraatsproject, onderzocht Charlotte Adams post-translationele modificaties in virus-gastheer eiwit-eiwit interacties met behulp van open modification searching. Daarna verbeterde ze de identificatie van immunopeptiden door een ground truth timsTOF dataset te genereren en het deep learning model Prosit te fine-tunen. Momenteel onderzoekt ze de identificeerbaarheid van proteomics data.
Frédérique Vilenne
Frédérique Vilenne is een doctoraatsstudent verbonden aan de Universiteit Hasselt en VITO en wordt begeleid door Prof. Dirk Valkenborg. Frédérique heeft een M.Sc. in statistiek en data science, gespecialiseerd in bio-informatica. Als onderdeel van het “Beyond the Genome”-project zal hij zich voornamelijk richten op het toegankelijker maken van massaspectrometrie proteomics binnen een klinische setting op verschillende manieren, zoals de identificatie van spectra met relevante informatie en de betere identificatie van peptiden, met een hogere betrouwbaarheid. Frédérique heeft een persoonlijke interesse in machine- en deep learning frameworks en wil zijn onderzoeksvragen oplossen bouwend op deze frameworks.
Ina Devos
Als doctoraatsstudent verbonden aan Universiteit Antwerpen en VITO onderzoekt Ina Devos welke ethische vragen spelen in de context van proteomics-onderzoek. Daarnaast wil die onderzoeken hoe proteomics- en ethiekonderzoekers kunnen samenwerken om elkaars vakgebied te ondersteunen en verrijken. Daarom werkt ze verder aan de ontwikkeling van een Bioethics-in-Science methodologie, gebaseerd op nauwe betrokkenheid, samenwerking, en reflectie op proteomics en ethische onderzoekspraktijken.